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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002139`

染色体: Chr08 坐标: 19257741-19259597 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002139`
名称	SmilChr08G002139
描述	protein ALTERED XYLOGLUCAN 9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19257741 - 19259597 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001623`
GeneID	`131001623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001623`
原始查询	`SmilChr08G002139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED XYLOGLUCAN 9
产物	protein ALTERED XYLOGLUCAN 9
Arabidopsis	`AT3G03210` (AT3G03210) Pmr5/Cas1p GDSL/SGNH-like acyl-esterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821222] identity=54.8; qcov=1.01; evalue=6.04e-135; confidence=high
Rice	`Os10g0539400` - identity=45.3; qcov=0.973; evalue=5.11e-92; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016407 (acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057784144.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784144.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784144.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784144.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19258491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr8:19258898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C8
`Chr8:19258923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C8
`Chr8:19258923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:19258929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A21,B110,B127,B137,B138,B18,B20,B21,B47,B55,B77,B86,C31,C44,C54,C81
`Chr8:19258969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B53,C21,C36,C42
`Chr8:19258986`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	96	A18,A2,A20,A21,A3,A4,B1,B10,B102,B105,B108,B11,B110,B111,B112,B115,B117,B118,B124,B127,B13,B137,B138,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B30,B37,B4,B40,B41,B47,B48,B49,B51,B55,B58,B59,B64,B65,B68,B69,B72,B77,B78,B80,B81,B84,B86,B89,B9,B93,B95,C11,C13,C18,C20,C23,C25,C26,C27,C30,C31,C32,C34,C36,C39,C44,C46,C47,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C68,C69,C76,C78,C81,C82,C83,C84,D10,D4
`Chr8:19258989`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,D11
`Chr8:19258989`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:19259113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:19259119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:19259161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928161.1
CAAGCTAATATTATCCCTTATAAGCTACGTAATTATCCCTCATCTCATCTCATCTCTTCTCTAAACTTCATTTTCATCTTCCCTAAACCGCCATCAAATCTCCCACTTTCTCTCGCTTCCTATTTTCTCACATCGCCAAATTCACCTGAAAAACCCTCCTTCCAAAGTTATCGCGCTAAGAATTTTGCAGCTATCAATTTGTTAGTCCATCGCCATCACTCTCCAAACCCCTCTTTCTGGCAGGAAACTTCTCGCTGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001623
ATGCTAGGGGCCGTTCAGCTCGGACTGTTAGCGGCCTGCGTAGTTCTTTTTGTGCCGATGGGTATGGCGGGCTGGCATTTGAGCCGCAACAAGATGCTCTTCTTCAGCTGCGCCCTCTTCATCACCCTCGCCGTCGGCGTGCATCTGACGCCCTATTTTCCTTCAATCTCCGCTTTCCTCTCGCCATCGGAGGTAATTTCGACCCCAGCTTCTTTGTATCGTGATTCCTGCGTGCTTTTGCTTCATAGAGTTGTGTATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784144.1
MLGAVQLGLLAACVVLFVPMGMAGWHLSRNKMLFFSCALFITLAVGVHLTPYFPSISAFLSPSEVISTPASLYRDSCVLLLHRVVYSDVGECDDIGANFDDNENGCKRSWDWTKNGEVDECDFQKLKKSDASDLLNGSWVVVAGDSQSRLMVVSLLELVMGSEGVERIKGDLFKRHSDYSVMVEEIGMKLDFVWAPYVANLTELTLRYKGSKDFPDILMMGAGLWDMLHVNNVSEFGVSLRVLRDSVLTLLPVSSSLDAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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