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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002140`

染色体: Chr08 坐标: 19261704-19263290 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002140`
名称	SmilChr08G002140
描述	uncharacterized SmilChr08G002140
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19261704 - 19263290 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998162`
GeneID	`130998162`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998162`
原始查询	`SmilChr08G002140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.6; qcov=0.463; evalue=3.85e-41; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779577.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779577.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779577.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779577.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779577.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19261725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:19261758`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B71,D3
`Chr8:19261758`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B71,D3
`Chr8:19261815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B65,B83
`Chr8:19261824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:19261825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B24,B29
`Chr8:19261841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:19261851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B122,B71
`Chr8:19261854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:19261871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B120,C42
`Chr8:19261883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A21,A22,A3,B103,B104,B111,B113,B120,B123,B134,B16,B18,B2,B27,B30,B35,B36,B37,B47,B63,B68,B76,B82,B87,B94,C1,C29,C3,C35,C36,C39,C40,C44,C5,C65,C77,D6
`Chr8:19261898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B108,B134,B66,C33

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923594.1
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTGCAAAACTCATCAAATGGGATGCTTCACTATGGGACAGCCAAGGCAGCCATGGAGAAATGGGGATGCTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGTAAAAGAGGAACATGCACAAGGTCAGTTGGTCACCGTTCAAAGCAAAAAAATCAGTAAGAGTCGAAGGAAAAGAGTGCACATAGATTTGGAACTCATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998162
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTGCAAAACTCATCAAATGGGATGCTTCACTATGGGACAGCCAAGGCAGCCATGGAGAAATGGGGATGCTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGTAAAAGAGGAACATGCACAAGGTCAGTTGGTCACCGTTCAAAGCAAAAAAATCAGTAAGAGTCGAAGGAAAAGAGTGCACATAGATTTGGAACTCATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779577.1
MTRRKDLSGAERQAIALFLLQNSSNGMLHYGTAKAAMEKWGCCRSSIARLWKAVKEEHAQGQLVTVQSKKISKSRRKRVHIDLELISSLELHKRGTIRRLATGINCSKSTVGRWISKGLIRPHSSAIRPDLTAPNKLLRLRFSLEQIVYGRICNVLKFNNMHNVIHADEKWFYMSKVNHKFYLTPAEIDPHRTCKSKKFIKKIMFLCAVCRPLFDEDGNVLFDGKIGIFPFTEMVPAKRKSKNREAGTLEEKPIQSITKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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