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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002153`

染色体: Chr08 坐标: 19416592-19420788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002153`
名称	SmilChr08G002153
描述	probable dolichyl pyrophosphate Man9GlcNAc2 alpha-1,3-glucosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19416592 - 19420788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001570`
GeneID	`131001570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001570`
原始查询	`SmilChr08G002153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable dolichyl pyrophosphate Man9GlcNAc2 alpha-1,3-glucosyltransferase
产物	probable dolichyl pyrophosphate Man9GlcNAc2 alpha-1%2C3-glucosyltransferase
Arabidopsis	`AT5G38460` (AT5G38460) ALG6, ALG8 glycosyltransferase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833834] identity=59; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0164500` (P0039H02.105) - identity=55.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0006490 (GO:0006490); GO:0042281 (dolichyl pyrophosphate Man9GlcNAc2 alpha-1,3-glucosyltransferase activity)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03155 (Alg6_Alg8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057784023.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057784023.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784023.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784023.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19416836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:19418037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:19418958`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B55,B57,C7
`Chr8:19418958`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B55,B57,C7
`Chr8:19418964`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B55,B57,C7
`Chr8:19418964`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B55,B57,C7
`Chr8:19419843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B71,C80
`Chr8:19420274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:19420307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C23,C82,D7
`Chr8:19420533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B53,C21,C36,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784023.1

522 aa

261

522

Alg6_Alg8

PF03155 Alg6_Alg8 48-499 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784023.1`	Pfam	`PF03155`	Alg6_Alg8	Family	48	499	1.9e-140	469.8	ALG6, ALG8 glycosyltransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928040.1
TTAGAAGACAACGAATTTTGAATGAATTTTTTTAAAGTCGAGCAGTGAATAATTTGCAGGCGGGTTGATTCATTCACAGCTAGTAGTTAAGCAATACAGATAATTTCGTAGCAGCCTCTGGCGAAAAACACTACGCTGAAATTCCAAAATATTTTCCTGCAAAACAACAATGGCGAGCCGAAAGAAGAAGAGTAGCGGACCTAACGACCCGCCCAAAACCATGCCCGAACCCGATCCACAATCTGAATTCTGGTCATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001570
ATGGCGAGCCGAAAGAAGAAGAGTAGCGGACCTAACGACCCGCCCAAAACCATGCCCGAACCCGATCCACAATCTGAATTCTGGTCATTCATCACCGCCAGAAGCACAAAATCATGGTTCCTCTGCATAAGCCTCTTCGCCGTTTTTATTCGCCTCGCCGTCGCGCTCCACCCCTATTCCGGCGCCAACACGCCGCCGATGTTCGGCGATTACGAGGCGCAGCGCCACTGGATGGAGATTACTATCAATCTGCCGCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784023.1
MASRKKKSSGPNDPPKTMPEPDPQSEFWSFITARSTKSWFLCISLFAVFIRLAVALHPYSGANTPPMFGDYEAQRHWMEITINLPPEEWYRNSTVNDLGYWGLDYPPLTAYQSYFHGIFLRLFDPASVALSDSRGYESYIGKLLMRWTVLMSDLMIFFPAVLYFVTVYYSGKPNGKKSNKAWHTMMILLNPCLILIDHGHFQYNCISLGLTTAAAAAILSNRDLVGSILFCLALNHKQMSAYYAPAFFAYLFGKCLRRQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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