当前解析结果
SmilChr08G002169| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002169 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002169 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002169 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 19622822 - 19627835 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001630 |
|---|---|
| GeneID | 131001630 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001630 |
| 原始查询 | SmilChr08G002169 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833821]; symbol=AT5G38380; hit=AT5G38380; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | zinc transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833821]; symbol=AT5G38380; hit=AT5G38380; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G38380 (AT5G38380)zinc transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833821] identity=70.2; qcov=0.983; evalue=2.29e-177; confidence=high |
| Rice | Os07g0283200- identity=63.1; qcov=1.03; evalue=6.8e-167; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001630 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 1.00000 | XP_057784153.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.80000 | XP_057784155.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784153.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784153.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784153.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:19626008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D3 |
Chr8:19626053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,C17 |
Chr8:19626563 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,C52,C83,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。