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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002170`

染色体: Chr08 坐标: 19627933-19630021 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002170`
名称	SmilChr08G002170
描述	40S ribosomal protein S7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19627933 - 19630021 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001684`
GeneID	`131001684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001684`
原始查询	`SmilChr08G002170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S7
产物	40S ribosomal protein S7
Arabidopsis	`AT3G02560` (AT3G02560) Ribosomal protein S7e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821308] identity=77.5; qcov=1; evalue=9.02e-111; confidence=high
Rice	`Os03g0297100` (RPS7a) - identity=76.4; qcov=1; evalue=2.43e-110; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0030686 (90S preribosome); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0042274 (ribosomal small subunit biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01251 (Ribosomal_S7e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784235.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784235.1`
3	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057784235.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057784235.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057784235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19628773`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B110,B111,B21,B27,B41,B61,B65,B97,C1,C15,C23,C24,C41,C61,C8,C83,D2,D7
`Chr8:19628820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr8:19628954`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C56,D11
`Chr8:19628954`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C56,D11
`Chr8:19628990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:19629122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:19629125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784235.1

191 aa

191

Ribosomal_S7e

PF01251 Ribosomal_S7e 7-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784235.1`	Pfam	`PF01251`	Ribosomal_S7e	Family	7	186	4.6e-80	268.4	Ribosomal protein S7e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928252.1
ATTGAGGCCCAATTTTTAGGGTTTTAGGTCTAATATATACTCTCTCATGCGCCAACCACATCCTTCTCTTCGTTACTCTCTGTAATTTCTAACTCCGGCGCCAAAGCTTTCTCCTCTGTCGCGCTCAACCGAGAGGGTCAATATGTATACTGCATTGCAAAAAATTCACAAAGACAGGGATGCTGAACCCTCTGAATTTGAGGAGAATGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTGGAAAATACCAACCAAGACATTAAGAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001684
ATGTATACTGCATTGCAAAAAATTCACAAAGACAGGGATGCTGAACCCTCTGAATTTGAGGAGAATGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTGGAAAATACCAACCAAGACATTAAGAGTGACTTGAAAGACCTCTATATTAACTCTGCAGTCCAAATTGATGTTGCTGGAGGTAAGAAGGCTGTTGTGATCCACGTCCCCTACCGACTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTCACCCTAGGCTGGTGAGAGAGCTTGAGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784235.1
MYTALQKIHKDRDAEPSEFEENVAQALFDLENTNQDIKSDLKDLYINSAVQIDVAGGKKAVVIHVPYRLRKAFRKIHPRLVRELEKKFSGKEVVVIATRRIVRPPKKGSAVQRPRSRTLTSVHEAVLEDVVYPAEIVGKRIRYRLDGSKIMKVFLDPKARNDTETKLETFAGVYRKLSGKDVVFEFPTLEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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