当前解析结果
SmilChr08G002176| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002176 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002176 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002176 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 19675917 - 19677640 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001694 |
|---|---|
| GeneID | 131001694 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001694 |
| 原始查询 | SmilChr08G002176 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831474]; symbol=AT5G16160; hit=AT5G16160; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831474]; symbol=AT5G16160; hit=AT5G16160; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G16160 (AT5G16160)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831474] identity=42.6; qcov=0.993; evalue=7.46e-22; confidence=medium |
| Rice | Os01g0689600- identity=33.9; qcov=0.949; evalue=3.28e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001694 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057784254.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057784254.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784255.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784255.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057784255.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:19676481 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 105 | A1,A10,A19,A5,A7,B1,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B113,B115,B118,B119,B123,B124,B126,B128,B131,B133,B135,B139,B140,B15,B17,B19,B2,B22,B25,B26,B3,B35,B36,B38,B39,B44,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B55,B57,B59,B60,B61,B70,B71,B72,B76,B77,B81,B85,B87,B90,B91,B92,B97,C1,C10,C12,C14,C15,C17,C18,C19,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C33,C34,C35,C38,C40,C46,C52,C53,C55,C56,C58,C61,C62,C71,C73,C74,C8,C80,C81,C82,C83,C85,D11,D3,D6,D9 |
Chr8:19676513 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr8:19676613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,C85 |
Chr8:19676629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。