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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002178`

染色体: Chr08 坐标: 19689894-19693092 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002178`
名称	SmilChr08G002178
描述	delta(7)-sterol-C5(6)-desaturase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19689894 - 19693092 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001653`
GeneID	`131001653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001653`
原始查询	`SmilChr08G002178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	delta(7)-sterol-C5(6)-desaturase-like
产物	delta(7)-sterol-C5(6)-desaturase-like
Arabidopsis	`AT3G02580` (STE1) sterol 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820679] identity=78; qcov=0.989; evalue=1.02e-157; confidence=high
Rice	`Os01g0134500` (OsSTE1) - identity=71.6; qcov=0.989; evalue=2.23e-145; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057784194.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057784194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784194.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784194.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19690208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C21,C69
`Chr8:19690239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:19690268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:19691382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C21,C69
`Chr8:19692524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784194.1

271 aa

136

271

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 131-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784194.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	131	259	2.9e-20	73.7	Fatty acid hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928211.1
TAGTAATATTTTGTCGAGAGATTATTTAATACTAATAATTGGTGTCCTTTTCTTTTGGGTTAATTTCATTGTTAAGAATTACACAGCAGAGCTATTCGCATCTGTGAGTAGACAAAAAAAGGAAATCCGTAAATATAAGACGGCTACACGCACACACACACACACACTCTCCCCCTCTCTCTTTCTATCTCTCTCCCTCCCCCTCCAACTATCCCTCATCGGAATTCTCTCTCTCTCTCAAAAGAGGCAAGAACCCACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001653
ATGGAGGATCAGCTGCGGCTGTTTGTGGATGAGACGTCGTGGTACAACGACGTCGTTTTGGGGGCGGTGCTGCCGGCGAAGTGGTGGGCCCCACTCCCCCACTTCTACAGAGGCTGGCTGCGGAACTACATTGGCGGGACCTTGCTGTACCTGGTGTCCGGGATCTTATGGTGTTTCTATATCTACTACTTGAAGCGCAACGTCTATCTTCCTAAAGATGCCATTCCTACTCGAAAAGCCATGCTTTTGCAGATAAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784194.1
MEDQLRLFVDETSWYNDVVLGAVLPAKWWAPLPHFYRGWLRNYIGGTLLYLVSGILWCFYIYYLKRNVYLPKDAIPTRKAMLLQIKVAMKAMPWYCALPTISEYMIEHGWTKSFPRISDVGFVEYLCYMSVYLIIVEFGIYWMHRELHDIKPLYKYLHATHHIYNKQNTLSPFAGLAFHPLDGILQAVPHVIALFLVPMHFTSHIALLFIEALWTANIHDCIHGQIWPVMGAGYHTIHHTTYRHNYGHYTIWMDWMFGTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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