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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002179`

染色体: Chr08 坐标: 19694132-19695608 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002179`
名称	SmilChr08G002179
描述	uncharacterized SmilChr08G002179
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19694132 - 19695608 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998166`
GeneID	`130998166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998166`
原始查询	`SmilChr08G002179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=37.5; qcov=0.468; evalue=7.71e-45; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779580.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779580.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779580.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779580.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19694154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr8:19694192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B71
`Chr8:19694239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:19694261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A15,A18,A4,B106,B11,B115,B118,B119,B120,B124,B126,B129,B132,B134,B14,B140,B17,B2,B37,B39,B49,B51,B59,B62,B70,B71,B72,B77,B78,B84,B88,C12,C14,C17,C24,C25,C26,C27,C34,C4,C42,C47,C56,C6,C62,C64,C65,C66,C70,C73,C78,C87,D1,D11,D9
`Chr8:19694285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:19694351`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr8:19694351`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A16
`Chr8:19694352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B29,B43,C51
`Chr8:19694360`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A16
`Chr8:19694360`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A16
`Chr8:19694412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B27,B69,C78
`Chr8:19694418`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779580.1

462 aa

231

462

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779580.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	5e-12	46.0	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923597.1
ATGAGAAGAAAGGATTTAACAACAGATGAGAGGTCTTCAATGCTTCAATTCCTTCTTCTTGAAAGCAAAAATGGTAAGCCACCAAGAGGGAAGATGAAAGCTATGGAGGAGAAGTTCCACGTCTGCCGGCGAACTGTTTCGCGCATTTGGGCTGAGGCAAAACAACAACAAAATCAAGGGCATGCCACAAATTCATCAAGTAAGAAGATAGCAAGACCAAGAAGAAAAAGAGTTGAAATAGACCTAGAGCTAATTGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998166
ATGAGAAGAAAGGATTTAACAACAGATGAGAGGTCTTCAATGCTTCAATTCCTTCTTCTTGAAAGCAAAAATGGTAAGCCACCAAGAGGGAAGATGAAAGCTATGGAGGAGAAGTTCCACGTCTGCCGGCGAACTGTTTCGCGCATTTGGGCTGAGGCAAAACAACAACAAAATCAAGGGCATGCCACAAATTCATCAAGTAAGAAGATAGCAAGACCAAGAAGAAAAAGAGTTGAAATAGACCTAGAGCTAATTGCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779580.1
MRRKDLTTDERSSMLQFLLLESKNGKPPRGKMKAMEEKFHVCRRTVSRIWAEAKQQQNQGHATNSSSKKIARPRRKRVEIDLELIASLDLTKRSTIRRLANGINCSKSTVGRWIDQGLIKAHTSALRPDLTAQNKLLRLRFCLDAIEMGRLSHNLRFKSMQNIVHVDEKWFYLTKSSHRFYLTPTEAEPHRTCKNKNFIKKVMFISAVCRPLFAADGSIIFDGKIGIFPFTEMVAAKRSSKNRVVGTLEQKPIESVSKPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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