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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002194`

染色体: Chr08 坐标: 19832793-19834731 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002194`
名称	SmilChr08G002194
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 14
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19832793 - 19834731 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001639`
GeneID	`131001639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001639`
原始查询	`SmilChr08G002194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 14
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 14
Arabidopsis	`AT1G66810` (AT1G66810) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842999] identity=45.1; qcov=0.887; evalue=1.48e-73; confidence=high
Rice	`Os05g0576300` (OsC3H39) - identity=49.8; qcov=0.822; evalue=2.93e-68; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784174.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057784174.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057784174.1`
4	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057784174.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057784174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19833025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:19833163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B108
`Chr8:19833164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,B90,B92,C75
`Chr8:19833209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:19833407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:19833417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B124
`Chr8:19833597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:19834302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:19834350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C80
`Chr8:19834359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,C14,C19,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784174.1

320 aa

160

320

zf-CCCH

PF00642 zf-CCCH 238-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784174.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	238	263	1.1e-15	57.8	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928191.1
TTATCATTGGCTCAAACTCATGACCTCTTGTACACCGGCACATATCCAGTATTTTCTCTTCTCATGCTTTATATTCTCCCGCTCTCTTGCTACTCTGCTCAGACCCAATTCCCCTGTTTCTCAACAACAATCACTAACTGCTTTAGGTCTCGTGATTTCTGCGTCTCAGAGAGTTTTCCGGTGCGATGCAGAAGGAGAATACCTCATTTTCCGTCCTCACCACCACCTCCGCCGCCGACGCTGCGCCGCATTGTTTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001639
ATGCAGAAGGAGAATACCTCATTTTCCGTCCTCACCACCACCTCCGCCGCCGACGCTGCGCCGCATTGTTTCTCTCGGAGCAATTTCTTTCTCTCACCTAATTCGCGGACTGATTATCTCAACTCCGACGCCTCCTTGTACTCCTCGCTGTTTCAGAAGTACACTACAGACGCTGCATCTTTCGACGGCGGCGATGCCGAGCGCCGCTGCCATGATTCGAGCAGCATCCTCGAGTACCAGCAGCTCTACAACCGCTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784174.1
MQKENTSFSVLTTTSAADAAPHCFSRSNFFLSPNSRTDYLNSDASLYSSLFQKYTTDAASFDGGDAERRCHDSSSILEYQQLYNRYTLCISRLRDSIEEVDALRRDNESLRVSNADLSRRVALLFSRERLLSEFNRLGVASPTAAAPVSVPVPVHVPAPQPLAECNRFERRNPEKTVLPKSISVRSKGYLKMMNRSGREPSIQKTVSQPSPPSQRVYVPGAKEEEDALEFDVYNQGMFKTELCNKWEETGACPYGENCQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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