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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002195`

染色体: Chr08 坐标: 19836177-19841497 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002195`
名称	SmilChr08G002195
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19836177 - 19841497 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001678`
GeneID	`131001678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001678`
原始查询	`SmilChr08G002195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit C-3-like
Arabidopsis	`AT1G56170` (NF-YC2) nuclear factor Y, subunit C2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842070] identity=47.8; qcov=0.46; evalue=9.74e-32; confidence=medium
Rice	`Os06g0667100` (OsHAP5B) - identity=42.9; qcov=0.616; evalue=7.14e-34; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784227.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784227.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784227.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784227.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19838212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr8:19839702`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr8:19839702`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr8:19839864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A25,C70
`Chr8:19840031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C85
`Chr8:19840046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:19840176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:19840207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:19840232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784227.1

250 aa

125

250

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 81-146 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 82-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784227.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	81	146	2.8e-12	47.5	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057784227.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	82	145	1.6e-13	51.4	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928244.1
CCTTTGATATTTATAAGCTCTTTTACCTATTGGTGCTCAATTAAACTCTTGGTTTGAAAATGGATAATAATAGGGAAAAGAAGGTAATGAACTTGAGCCATTCATCGTCGGCATCACAACAACCTTTTCAAATGCACAATTTTATGCCGATGCCTTCCTCTTCTCTTCATGTTGACCATCATCAGTGCGAAGCCGAAAGAGGTGCATCTTTCGTGAACCAATTGAAAGAAATTATGCAAAGTTTTTGGAGAGACAGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001678
ATGGATAATAATAGGGAAAAGAAGGTAATGAACTTGAGCCATTCATCGTCGGCATCACAACAACCTTTTCAAATGCACAATTTTATGCCGATGCCTTCCTCTTCTCTTCATGTTGACCATCATCAGTGCGAAGCCGAAAGAGGTGCATCTTTCGTGAACCAATTGAAAGAAATTATGCAAAGTTTTTGGAGAGACAGACTTTCTGAGATATGTGACGCTCCTACTGATGTCCGCAGTCCACACACACTGCCATTAGCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784227.1
MDNNREKKVMNLSHSSSASQQPFQMHNFMPMPSSSLHVDHHQCEAERGASFVNQLKEIMQSFWRDRLSEICDAPTDVRSPHTLPLARIKKVMKSDEKVKMISGDTPALFGKACEIFVMELSVRAWMHTQLNNRKTVQRNDVAYAIRDDATLLAFLDDVVPLESHHEPQVSISHHHGVYVPHPFTNQSLLEGGGRPDHDHHLPFPINLHHNYNPDAHVHMGRSGGEQHINHNFPPSYDGTNPYLTFKEFFQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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