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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002217`

染色体: Chr08 坐标: 20173422-20174546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002217`
名称	SmilChr08G002217
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20173422 - 20174546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998173`
GeneID	`130998173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998173`
原始查询	`SmilChr08G002217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=28.6; qcov=0.903; evalue=4.98e-23; confidence=low
Rice	`Os07g0525300` - identity=42.5; qcov=0.758; evalue=2.02e-47; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02892 (zf-BED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779587.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779587.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779587.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779587.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20173485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C65
`Chr8:20173495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B42,B43
`Chr8:20173534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B117,B12
`Chr8:20173547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B117,B12
`Chr8:20173603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B117,B12
`Chr8:20173835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B35
`Chr8:20173921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C53,C68
`Chr8:20173973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr8:20173987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C53
`Chr8:20174004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B105,B123,C23
`Chr8:20174032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B123,B71,C40
`Chr8:20174113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779587.1

248 aa

124

248

zf-BED

PF02892 zf-BED 61-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779587.1`	Pfam	`PF02892`	zf-BED	Domain	61	101	1.5e-07	32.0	BED zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923604.1
ATGTCAATGTCTACCACAGGATGCTCTGAATCAAAGAAGAGTGAAAATAAGTTGGCAGAAGAAAGCTTTGTTGAACAACTTGTGAATGTGATTGTACTTGAAAATGATTCCACCAATGCTAAAATCGTTGGGACCACGGAAGTGAAAGTAGAAGATGGTAAAATGGCCAAGAAACGTACTTCTAAAGCTTGGGATCATTTCAAGATAATAATGGTGAATGGTGTTCAAAAGGCAAAATGCAACTACTGCACGGCTACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998173
ATGTCAATGTCTACCACAGGATGCTCTGAATCAAAGAAGAGTGAAAATAAGTTGGCAGAAGAAAGCTTTGTTGAACAACTTGTGAATGTGATTGTACTTGAAAATGATTCCACCAATGCTAAAATCGTTGGGACCACGGAAGTGAAAGTAGAAGATGGTAAAATGGCCAAGAAACGTACTTCTAAAGCTTGGGATCATTTCAAGATAATAATGGTGAATGGTGTTCAAAAGGCAAAATGCAACTACTGCACGGCTACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779587.1
MSMSTTGCSESKKSENKLAEESFVEQLVNVIVLENDSTNAKIVGTTEVKVEDGKMAKKRTSKAWDHFKIIMVNGVQKAKCNYCTATLSYNGTSGTSHLLKHANLVCPKRHLRLGLGQTKLNVKTEVDGTTVLELKDREKPVKFDQETSRRDLVSMVVIHEYPLSIVDHVGFRKFVKGFNSSFKMISRNTLKSAIMKIYNDAKSSLKALFDSTYERVALTTDMWTASNQKKGYMAITSHFIDQQWIIEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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