当前解析结果
SmilChr08G002229| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002229 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002229 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002229 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 20354336 - 20354813 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998176 |
|---|---|
| GeneID | 130998176 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998176 |
| 原始查询 | SmilChr08G002229 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998176 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779591.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779591.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779591.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779591.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779591.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:20354339 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C76,D8 |
Chr8:20354360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,A25,B114,B122,C7 |
Chr8:20354405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,B114,B122,C7 |
Chr8:20354406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A4,C36,C41,C64 |
Chr8:20354427 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr8:20354488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:20354496 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,A8,B137,B16,B40 |
Chr8:20354505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C41 |
Chr8:20354614 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B35 |
Chr8:20354614 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr8:20354720 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr8:20354728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B107,C14,C87,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。