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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002237`

染色体: Chr08 坐标: 20486353-20496391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002237`
名称	SmilChr08G002237
描述	uncharacterized protein At4g37920-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20486353 - 20496391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001767`
GeneID	`131001767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001767`
原始查询	`SmilChr08G002237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoribonuclease E-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829948]; symbol=AT4G37920; hit=AT4G37920; species=arabidopsis; confidence=high
产物	endoribonuclease E-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829948]; symbol=AT4G37920; hit=AT4G37920; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G37920` (AT4G37920) endoribonuclease E-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829948] identity=72.7; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0306800` (P0552C05.41-2) - identity=59.9; qcov=0.842; evalue=2.2e-149; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG	-
Pfam	PF26740 (DUF8246); PF30870 (At4g37920_C); PF30872 (At4g37920_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784318.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057784318.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784318.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784318.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20486400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B104,B111,B28
`Chr8:20486406`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr8:20486406`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr8:20486413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B54,B98
`Chr8:20486414`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr8:20486414`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr8:20486427`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B107,B36,B99,C15,C24,C32,C56,C8,C87
`Chr8:20486441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,C12,C46
`Chr8:20486448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C70,C87,D7
`Chr8:20486494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B117,B12
`Chr8:20486527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:20486528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784318.1

412 aa

206

412

DUF8246

At4g37920_M

At4g37920_C

PF26740 DUF8246 76-219 aa PF30872 At4g37920_M 235-301 aa PF30870 At4g37920_C 305-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784318.1`	Pfam	`PF26740`	DUF8246	Domain	76	219	9e-62	208.0	Domain of unknown function (DUF8246)
`XP_057784318.1`	Pfam	`PF30872`	At4g37920_M	Domain	235	301	3.8e-36	123.6	At4g37920-like middle domain
`XP_057784318.1`	Pfam	`PF30870`	At4g37920_C	Domain	305	398	4.5e-43	146.3	At4g37920-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928335.1
ATATTGCAAATTTGCAATTTTGTAAACTGAAACAGAGCGCTACTATGGCCTGTAAACTCTCGCTCTTCAGCTCCACTCTCTCTCTAATCCATCCAGAAATATCTCTACATTCTGCAAAATTACCACTTCAGTTACCAATTTCTCAAAATTTCCAAAGCTTTACAGCTGCAAAATCGAGAAGAACCGAAGATGCGTGGCAGTTTTGCGCTACTGCATCTGGAACGGAGGTTGAGGTTGAAGCTGACGTTGAAGTTGAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001767
ATGGCCTGTAAACTCTCGCTCTTCAGCTCCACTCTCTCTCTAATCCATCCAGAAATATCTCTACATTCTGCAAAATTACCACTTCAGTTACCAATTTCTCAAAATTTCCAAAGCTTTACAGCTGCAAAATCGAGAAGAACCGAAGATGCGTGGCAGTTTTGCGCTACTGCATCTGGAACGGAGGTTGAGGTTGAAGCTGACGTTGAAGTTGAAGTTGCAGAGGGGTACACGATAACCCAATTTATTGATAAGATCATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784318.1
MACKLSLFSSTLSLIHPEISLHSAKLPLQLPISQNFQSFTAAKSRRTEDAWQFCATASGTEVEVEADVEVEVAEGYTITQFIDKIIDVFLNEKPKSRDWKKYLIFREEWGNYRQKFYNRCKTRADSEKDSHIKQKLVDLSRRVRKIYEEMEKHTALLKEIQDSPMDINAIVAKRRGDFTDSFFRHLTLVSETYDSLEDRDAVARLGTRCLSAVSAFDNTLEIVGTLDIAQAKFDDILNSPSIDAACEKIKNLAKAKELDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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