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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002255`

染色体: Chr08 坐标: 20783528-20791542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002255`
名称	SmilChr08G002255
描述	uncharacterized SmilChr08G002255
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20783528 - 20791542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001781`
GeneID	`131001781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001781`
原始查询	`SmilChr08G002255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0531300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0531300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G49640` (AT3G49640) Aldolase-type TIM barrel family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824126] identity=80.1; qcov=0.967; evalue=1.04e-175; confidence=high
Rice	`Os04g0531300` - identity=78.9; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002943 (tRNA dihydrouridine synthesis); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0017150 (tRNA dihydrouridine synthase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF01207 (Dus)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784345.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057784345.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057784348.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057784345.1`
5	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057784348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20784512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C67
`Chr8:20789714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784345.1

324 aa

162

324

Dus

PF01207 Dus 11-258 aa

XP_057784346.1

324 aa

162

324

Dus

PF01207 Dus 11-258 aa

XP_057784347.1

324 aa

162

324

Dus

PF01207 Dus 11-258 aa

XP_057784348.1

305 aa

152

305

Dus

PF01207 Dus 22-239 aa

XP_057784349.1

305 aa

152

305

Dus

PF01207 Dus 11-258 aa

XP_057784350.1

301 aa

150

301

Dus

PF01207 Dus 19-235 aa

XP_057784351.1

301 aa

150

301

Dus

PF01207 Dus 19-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784345.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	11	258	2.6e-58	198.3	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784346.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	11	258	2.6e-58	198.3	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784347.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	11	258	2.6e-58	198.3	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784348.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	22	239	9.3e-55	186.6	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784349.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	11	258	2.3e-58	198.5	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784350.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	19	235	3.6e-54	184.7	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057784351.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	19	235	3.6e-54	184.7	Dihydrouridine synthase (Dus)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928364.1
ATTATTAGCCCCATTGCCCCAATTTACTAGTTAAACAAAATTCAAAATAAAAGTAGAAATTCTCAGCCCAACTCTCCCTCACTGCCGCCGCCCGAACCGCCCCGCCCCTCCTCCTCCGGCAGTACTCACACCACGGCACGTCGGCAGCAGCGCTGAAAACCTGCTGCAGTCCGCCAGCTGCACTGCCTCTCGGGCCTCAGCGCCTCCGCCCGGCCTTCCCAGCAGCAGCCAGCAAAAGCAGAATGGAGATTGATTATTGG...

XM_057928368.1
TTATTAGCCCCATTGCCCCAATTTACTAGTTAAACAAAATTCAAAATAAAAGTAGAAATTCTCAGCCCAACTCTCCCTCACTGCCGCCGCCCGAACCGCCCCGCCCCTCCTCCTCCGGCAGTACTCACACCACGGCACGTCGGCAGCAGCGCTGAAAACCTGCTGCAGTCCGCCAGCTGCACTGCCTCTCGGGCCTCAGCGCCTCCGCCCGGCCTTCCCAGCAGCAGCCAGCAAAAGCAGAATGGAGATTGATTATTGGA...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC131001781
ATGGAGATTGATTATTGGAACAAGCTTGTACTTGCCCCGATGGTCCGAGTTGGCACGATGCCATTCAGGATGCTGGCTGCTGAATATGGTGCTCACATCACATATGGCGAGGAGATAATTGACCACAAAATCCTTAAATGCGAGCGACGAGTCAATGATGTGCTTGGGACTATTGATTTGGTTGAGAAAGGAACAGAGAGTGTAGTTTTCAGAACATGTCCTGAAGAAAAAAATCGGGTGGTGTTCCAGATGGGAACTTC...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057784345.1
MEIDYWNKLVLAPMVRVGTMPFRMLAAEYGAHITYGEEIIDHKILKCERRVNDVLGTIDLVEKGTESVVFRTCPEEKNRVVFQMGTSDPVRALRAAQTVCTDVAAVDINMGCPKAFSISGGMGAALLSKPDLIHDILTTLKRNLDTPVTCKIRLLKSLQDTVELARRIEKTGVSALAVHGRKVADRPRDPAKWNEIADVVAAVSIPVIANGDVFEYEDFERIKVATGASSVMVARGALWNASIFSSKGKLPWEDVKREYL...

XP_057784346.1
MEIDYWNKLVLAPMVRVGTMPFRMLAAEYGAHITYGEEIIDHKILKCERRVNDVLGTIDLVEKGTESVVFRTCPEEKNRVVFQMGTSDPVRALRAAQTVCTDVAAVDINMGCPKAFSISGGMGAALLSKPDLIHDILTTLKRNLDTPVTCKIRLLKSLQDTVELARRIEKTGVSALAVHGRKVADRPRDPAKWNEIADVVAAVSIPVIANGDVFEYEDFERIKVATGASSVMVARGALWNASIFSSKGKLPWEDVKREYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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