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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002262`

染色体: Chr08 坐标: 20877389-20878027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002262`
名称	SmilChr08G002262
描述	uncharacterized SmilChr08G002262
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20877389 - 20878027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998186`
GeneID	`130998186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998186`
原始查询	`SmilChr08G002262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=49.5; qcov=0.981; evalue=2.43e-59; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779601.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779601.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779601.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779601.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20877439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B38,B39,C14,C22
`Chr8:20877512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:20877531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:20877537`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A11,A3,A6,B100,B101,B103,B105,B121,B124,B130,B132,B26,B27,B62,B63,B69,B74,B75,B76,B81,B95,B98,C2,C42,C50,C62,C7,C73,C77,C78,D1,D3,D5
`Chr8:20877659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C71,C84
`Chr8:20877716`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B113,B123,B37,B48,B77,C1,C30,C76,C8,C86
`Chr8:20877762`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	A11,A3,A5,A6,B100,B101,B103,B105,B112,B115,B121,B124,B125,B130,B132,B135,B138,B14,B16,B24,B26,B27,B35,B38,B47,B55,B62,B63,B69,B7,B74,B75,B80,B93,B95,B98,C11,C13,C2,C21,C22,C29,C36,C42,C43,C45,C50,C61,C62,C69,C7,C73,C77,C78,C80,D1,D10,D2,D3,D4,D5
`Chr8:20877783`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B37,B77,C30,C8,C86
`Chr8:20877783`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B37,B77,C30,C8,C86
`Chr8:20877790`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B37,B77,C30,C8,C86
`Chr8:20877790`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B37,B77,C30,C8,C86
`Chr8:20877809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C30,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779601.1

212 aa

106

212

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 129-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779601.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	129	188	3e-09	37.2	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923618.1
ATGGAAATGATTGATATGGAAGATGAATATGCACCTCGAGGAAGAGGAAGGCGTAGAGTTGAGAAAATGACAAATCTCCACCATTGTCGAGTTGAGCTTTTTTACAATGTGATTGACATGCAAGCTTTAGAGTTGAATCAATGTTTTGATGAAGTCAGCACAAAATTGATTTTATGCATGTCGTGTTTGGATCCTAGAGACTCATCTGGATTTGATATTGAAAAGCTACATCGTCTTGCAAAGTTTTATCCGTCTGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998186
ATGGAAATGATTGATATGGAAGATGAATATGCACCTCGAGGAAGAGGAAGGCGTAGAGTTGAGAAAATGACAAATCTCCACCATTGTCGAGTTGAGCTTTTTTACAATGTGATTGACATGCAAGCTTTAGAGTTGAATCAATGTTTTGATGAAGTCAGCACAAAATTGATTTTATGCATGTCGTGTTTGGATCCTAGAGACTCATCTGGATTTGATATTGAAAAGCTACATCGTCTTGCAAAGTTTTATCCGTCTGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779601.1
MEMIDMEDEYAPRGRGRRRVEKMTNLHHCRVELFYNVIDMQALELNQCFDEVSTKLILCMSCLDPRDSSGFDIEKLHRLAKFYPSEFFEVALYELESQLENFIVDVCMDEKFLELSGIGDLAEKMVSTRKHDIFPLMYLLVKLSLTLPVATATIERVFSAMKIIKSVLRNRMRDNLLNDCLVPYIENDVFVNVTNEAIMQRLHNMKNRREML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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