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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002264`

染色体: Chr08 坐标: 20886453-20889483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002264`
名称	SmilChr08G002264
描述	V-type proton ATPase subunit F
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20886453 - 20889483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001787`
GeneID	`131001787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001787`
原始查询	`SmilChr08G002264`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit F
产物	V-type proton ATPase subunit F
Arabidopsis	`AT4G02620` (AT4G02620) vacuolar ATPase subunit F family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828221] identity=82.6; qcov=0.908; evalue=3.41e-67; confidence=high
Rice	`Os02g0824700` - identity=88.5; qcov=0.942; evalue=1.17e-72; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0033180 (proton-transporting V-type ATPase, V1 domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01990 (ATP-synt_F)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784362.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784363.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057784362.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784362.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20886901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr8:20886921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:20886934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C24
`Chr8:20886950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B125,B95,C23
`Chr8:20887001`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,A4,B55,B62,B93,C24,C30,C33,C64,D8
`Chr8:20887007`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A20,B93
`Chr8:20887007`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A20,B93
`Chr8:20887012`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A20,B93
`Chr8:20887012`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A20,B93
`Chr8:20888082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C24,C78
`Chr8:20888094`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B101,B11,B120,B16,C40,C62
`Chr8:20888107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784362.1

130 aa

130

ATP-synt_F

PF01990 ATP-synt_F 15-116 aa

XP_057784363.1

120 aa

120

ATP-synt_F

PF01990 ATP-synt_F 12-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784362.1`	Pfam	`PF01990`	ATP-synt_F	Family	15	116	6.2e-29	100.9	ATP synthase (F/14-kDa) subunit
`XP_057784363.1`	Pfam	`PF01990`	ATP-synt_F	Family	12	106	2.5e-25	89.4	ATP synthase (F/14-kDa) subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928379.1
ATGTTAAGGTTGTAGTAGCAATTTTTTTTTTGAATTGGGGAAAATAAAAAATAAAACTTCATATATTTTATTTTAAATTGTGTGCAAAATCAGAGTTGGTCCAAAGTTGTGTATTTTGATTTTTGGGACAATTTATTCAATTAATAATTTTCTTATTTTCGTATTTTCTTTTCCCTTGTACTTCTTCATTATTGCTGAATGTTGATCCACTGCGTAAACTCCTATCTAATCTCTCTCTCTCTCACGATCTACACACTTCC...

XM_057928380.1
ATATAGTTATGATTTATGTTTAGTTTCCGCTTCTCGCTCTACGAATGGGACACAATTACTGGATTTTTGTTAGCTGGAGTTGGGAATGTTGATTTGAGGAGGAAGACTAATTACCTCATAGTGGACTCAAAAACTACTGTGAAGCAGATTGAAGACGCCTTCAAAGATTTCACAGCAAGAGAAGACATTGCAATAGTTCTAATCAGTCAATATGTAGCAAATATGGTACGGTTTTTAGTGGACAGCTATAACAAACCAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001787
ATGGCGAACAAACCTCAAATCCGCACGAATAGCTCGGCGCTCATAGCTATGATCGCCGACGAGGACACAATTACTGGATTTTTGTTAGCTGGAGTTGGGAATGTTGATTTGAGGAGGAAGACTAATTACCTCATAGTGGACTCAAAAACTACTGTGAAGCAGATTGAAGACGCCTTCAAAGATTTCACAGCAAGAGAAGACATTGCAATAGTTCTAATCAGTCAATATGTAGCAAATATGGTACGGTTTTTAGTGGACAG...

LOC131001787
ATGTTTAGTTTCCGCTTCTCGCTCTACGAATGGGACACAATTACTGGATTTTTGTTAGCTGGAGTTGGGAATGTTGATTTGAGGAGGAAGACTAATTACCTCATAGTGGACTCAAAAACTACTGTGAAGCAGATTGAAGACGCCTTCAAAGATTTCACAGCAAGAGAAGACATTGCAATAGTTCTAATCAGTCAATATGTAGCAAATATGGTACGGTTTTTAGTGGACAGCTATAACAAACCAATCCCAGCCATCTTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784362.1
MANKPQIRTNSSALIAMIADEDTITGFLLAGVGNVDLRRKTNYLIVDSKTTVKQIEDAFKDFTAREDIAIVLISQYVANMVRFLVDSYNKPIPAILEIPSKDHPYDPAHDSVLSRVKYLFSSESVASDRR

XP_057784363.1
MFSFRFSLYEWDTITGFLLAGVGNVDLRRKTNYLIVDSKTTVKQIEDAFKDFTAREDIAIVLISQYVANMVRFLVDSYNKPIPAILEIPSKDHPYDPAHDSVLSRVKYLFSSESVASDRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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