当前解析结果
SmilChr08G002272| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002272 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002272 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002272 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 20993201 - 21004115 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001796 |
|---|---|
| GeneID | 131001796 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001796 |
| 原始查询 | SmilChr08G002272 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001796 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057784372.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057784372.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784372.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784372.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784372.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:20996780 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B42,B44,B51,C39,C54 |
Chr8:20996792 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,C42 |
Chr8:20996815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,C48 |
Chr8:20996889 |
TC |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A16,B19,C29 |
Chr8:20997038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr8:20997041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr8:20997067 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr8:20997068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr8:20997102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr8:20997107 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 61 | A13,A16,A3,A6,A8,A9,B10,B102,B106,B107,B109,B110,B113,B131,B134,B136,B138,B18,B2,B21,B3,B30,B33,B38,B39,B41,B49,B50,B51,B53,B56,B65,B7,B70,B78,B82,B84,B87,B96,B98,C14,C17,C20,C23,C30,C35,C39,C41,C5,C53,C55,C56,C61,C63,C66,C67,C70,C74,C79,C9,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。