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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002274`

染色体: Chr08 坐标: 21130301-21133600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002274`
名称	SmilChr08G002274
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21130301 - 21133600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001799`
GeneID	`131001799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001799`
原始查询	`SmilChr08G002274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL2
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL2
Arabidopsis	`AT5G65710` (HSL2) HAESA-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836700] identity=50.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0239700` - identity=42.4; qcov=0.994; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0033612 (receptor serine/threonine kinase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057784374.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784374.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784374.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784374.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21130526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B89,C25,C74
`Chr8:21130705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:21131041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B18,B66,B8,C9
`Chr8:21131318`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B35
`Chr8:21131318`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B35
`Chr8:21131320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C20
`Chr8:21131345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A1,A9,B100,B103,B105,B111,B114,B117,B125,B126,B129,B13,B135,B139,B2,B21,B29,B37,B38,B46,B47,B5,B53,B74,B76,B77,B78,B85,B92,B94,C1,C13,C20,C26,C37,C40,C49,C50,C55,C70,C71,C72,C73,C79,D1,D8
`Chr8:21131403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:21131451`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	41	A22,A23,A3,B10,B106,B111,B123,B124,B126,B129,B13,B139,B18,B2,B22,B24,B26,B33,B35,B54,B63,B64,B73,B76,B79,B84,C1,C13,C20,C27,C36,C40,C45,C54,C70,C84,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr8:21131463`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A22,A23,A3,B106,B111,B123,B124,B126,B18,B2,B22,B24,B26,B33,B35,B54,B63,B73,B76,B79,B84,B88,C2,C20,C27,C36,C45,C8,C84,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr8:21131466`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A22,A23,A3,B106,B123,B124,B126,B18,B2,B22,B24,B26,B33,B35,B54,B63,B73,B76,B79,B84,B88,C2,C20,C27,C36,C45,C8,C84,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr8:21131489`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B79,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784374.1

960 aa

480

960

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 29-70 aa PF00560 LRR_1 146-168 aa PF00560 LRR_1 170-192 aa PF00560 LRR_1 433-453 aa PF00560 LRR_1 458-479 aa PF00560 LRR_1 482-501 aa PF00560 LRR_1 530-551 aa PF00560 LRR_1 554-575 aa PF00069 Pkinase 689-952 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 690-954 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	29	70	1.8e-08	35.2	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	146	168	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	170	192	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	433	453	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	458	479	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	482	501	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	530	551	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	554	575	3.9e-46	145.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	689	952	5.1e-42	144.8	Protein kinase domain
`XP_057784374.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	690	954	1.3e-37	130.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928391.1
AGGCGCAAAATATCCATTTAATTCACAAGCATAGATAAGGAGTATCTATATTTTGAAGTGAAACAAAATTCAAACAGCCTTAACACTTGGTAATGATTGTGGGGTGGATCAAATCTAAGCCCAATGAATTATCATAATAATCTAGTTTTCCTTCTCATCACCGCCGTTTTCTTCATCACTTTGATGCGTTCAACAACAGATGCATCCAGCCGCGACGCTGCGATTCTACTCCGAGTCAAGACGAGTCAACTCCAAGACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001799
ATGAATTATCATAATAATCTAGTTTTCCTTCTCATCACCGCCGTTTTCTTCATCACTTTGATGCGTTCAACAACAGATGCATCCAGCCGCGACGCTGCGATTCTACTCCGAGTCAAGACGAGTCAACTCCAAGACCCGCTCGGAATGCTCCAAGACTGGCTTGAAAGCTCTCCCCACGCGCCATGCAACTGGACGGGGGTTTCTTGCACCGCCGCCGCTGTAGTTGCCTTGAACCTCCGCAGCGTCGGCATTTCTGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784374.1
MNYHNNLVFLLITAVFFITLMRSTTDASSRDAAILLRVKTSQLQDPLGMLQDWLESSPHAPCNWTGVSCTAAAVVALNLRSVGISGEFPADFCRISTLRNLDLSDNSLGGNISSDSISMCSHLFSLNLSSNYFVGSLPGFPVEFLNLSVLDFSINNFSGEIPANFVNLRSLQFLSLGSNLLNGSIPEFLSNLSELTQLVIALNPFRPSPLPANIGRLAKLEILMASMANLEGEIPESIGNLISIKLLDVSQNNLVGEIPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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