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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002278`

染色体: Chr08 坐标: 21181139-21183763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002278`
名称	SmilChr08G002278
描述	cytochrome c oxidase subunit 6a, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21181139 - 21183763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001803`
GeneID	`131001803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001803`
原始查询	`SmilChr08G002278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase subunit 6a, mitochondrial
产物	cytochrome c oxidase subunit 6a%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G37830` (AT4G37830) cytochrome c oxidase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829939] identity=67; qcov=0.99; evalue=1.49e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0772800` - identity=65.3; qcov=1; evalue=5.99e-41; confidence=medium
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0005751 (GO:0005751); GO:0006123 (mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen); GO:0030234 (enzyme regulator activity)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784378.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057784378.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057784378.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784378.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21181389`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr8:21181389`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr8:21181781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928396.1
CGCGTTTTTCATGTAGCCCTTCAACGACTTTCGGTTCTCAACGAGAAACGTGTTATTAGGCGTATCTGCGGGATTAATTATACTGGCATTGAATCGGCACACACACAACGCACAGACACAAGGGAAAAATACACAAAAATGGCGACGGCGATTGTGAGATCTACCCTCCGGTCCGCCCTACGCGGTGGCGCCTCCACCCCTCGCGTCTCACCGGCGTCCAGACGCTCTTTCTCCGCTTCATCCGGTCACGACGAAGCTGC...

XM_057928395.1
TTCAACGACTTTCGGTTCTCAACGAGAAACGTGTTATTAGGCGTATCTGCGGGATTAATTATACTGGCATTGAATCGGCACACACACAACGCACAGACACAAGGGAAAAATACACAAAAATGGCGACGGCGATTGTGAGATCTACCCTCCGGTCCGCCCTACGCGGTGGCGCCTCCACCCCTCGCGTCTCACCGGCGTCCAGACGCTCTTTCTCCGCTTCATCCGGTCACGACGAAGCTGCTGAGGCTTCCAAGTGGGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001803
ATGGCGACGGCGATTGTGAGATCTACCCTCCGGTCCGCCCTACGCGGTGGCGCCTCCACCCCTCGCGTCTCACCGGCGTCCAGACGCTCTTTCTCCGCTTCATCCGGTCACGACGAAGCTGCTGAGGCTTCCAAGTGGGAGAAGATTACATATTTGGGAATAGTGGCATGCTCTACTCTCGCTATCTTTAACCTCTCCAAGGGCCATCCGCACTACGACGAGCCTCCTGCATATCCATATTTGCATATCCGCAACAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784378.1
MATAIVRSTLRSALRGGASTPRVSPASRRSFSASSGHDEAAEASKWEKITYLGIVACSTLAIFNLSKGHPHYDEPPAYPYLHIRNKEFPWGEFPLLHMIHFHDICFVNACLSYLVLVCVDFCMCMDI

XP_057784379.1
MATAIVRSTLRSALRGGASTPRVSPASRRSFSASSGHDEAAEASKWEKITYLGIVACSTLAIFNLSKGHPHYDEPPAYPYLHIRNKEFPWGPDGLFEVKHH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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