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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002289`

染色体: Chr08 坐标: 21341246-21342261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002289`
名称	SmilChr08G002289
描述	transcription factor RAX3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21341246 - 21342261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001815`
GeneID	`131001815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001815`
原始查询	`SmilChr08G002289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor RAX3-like
产物	transcription factor RAX3-like
Arabidopsis	`AT5G65790` (MYB68) myb domain protein 68 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836708] identity=83.1; qcov=0.653; evalue=3.33e-78; confidence=high
Rice	`Os03g0771100` - identity=84.5; qcov=0.618; evalue=5.07e-75; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784394.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784394.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784394.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784394.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21341511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C16,C28,C82
`Chr8:21342170`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,A2,B139,B17,B28,B40,B61,C21,C25,C28,C40,C44,C53,C61,C76,D8
`Chr8:21342171`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A2,B139,B17,B28,B40,B61,C21,C25,C28,C40,C44,C53,C61,C76,D8
`Chr8:21342177`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr8:21342177`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784394.1

199 aa

100

199

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-62 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-77 aa PF00249 Myb_DNA-binding 69-112 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 71-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784394.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	62	4.9e-31	107.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057784394.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	77	1e-16	61.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057784394.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	69	112	4.9e-31	107.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057784394.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	71	116	1e-16	61.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928411.1
GCGCACACCTTGTTTTCATTTGTCAATCCATCGCCATATGTATCGTAAATGCAACCCTAGCCTAATCTTATATATATCTGACCCCACATGAAATATTCGAATTAAATGTGAAATTAGGGAGGGAGTGGATGTATATATATATATTAAGAGGAAAAGAAGGGAGAGTCGAGATTTGATTTGTAAAGATAAATTGAGAGGAAAGTGTAGTGATGGGGAGAGCTCCATGCTGCGACAAAGCCAAGGTAAAGAAAGGGCCATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001815
ATGGGGAGAGCTCCATGCTGCGACAAAGCCAAGGTAAAGAAAGGGCCATGGTCACCCGAAGAAGACGCCAAGCTCAAATCCCACATCCAAAATCACGGCACCGGCGGCAACTGGATCGCCCTCCCCACCAAAATAGGTCTGAAGAGATGCGGAAAGAGCTGTCGGCTTAGATGGCTGAATTATCTGAGACCTAACCTCAAGCACGGCAGTTTCACTGAAAACGAAGATATCTTAATCTGCAACCTCTATGTCACCATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784394.1
MGRAPCCDKAKVKKGPWSPEEDAKLKSHIQNHGTGGNWIALPTKIGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNLKHGSFTENEDILICNLYVTIGSRWSVIAAQLPGRTDNDIKNYWNTRLKKKLLGKQRRSSPAANIPPQPLPLPPFHHAQQHHNVYSPIIHLPSISMENVISWEHMNYQPWMLFDDPSLLPTLSPSLACFNDEFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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