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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002290`

染色体: Chr08 坐标: 21369519-21371345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002290`
名称	SmilChr08G002290
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21369519 - 21371345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001816`
GeneID	`131001816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001816`
原始查询	`SmilChr08G002290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
Arabidopsis	`AT4G37770` (ACS8) 1-amino-cyclopropane-1-carboxylate synthase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829933] identity=75.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0727600` (ACS1) 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4333976] identity=67.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784395.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057784395.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784395.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784395.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21369758`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr8:21369758`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr8:21369864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C7,D2
`Chr8:21369882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:21370160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr8:21370251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B129
`Chr8:21370335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:21370578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B36,C42
`Chr8:21371028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:21371064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:21371070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B12,B60,B87,C85
`Chr8:21371128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784395.1

461 aa

230

461

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 40-422 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784395.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	40	422	1.4e-104	350.9	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928412.1
ATGCCAGAAAGCAACTCAGTCTCCATCGACAAACCTTCTCTCAACTCTTGAAATTAACATTTCTACCTCTCTCTCTCTAGAAATTGTGTCAAGTTTAACACTCGATCATCATTATAGTAAATATTGGAGATTGAGAAACATAAAAAATGACGCTGTCGAAGAAGGCGACCTGCAACTCCCACGGGCAAGATTCATCCTACTTCCTGGGATGGGAGGAGTACGAGAAGAATCCTTACGACCAACTCCATAATCCCAACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001816
ATGACGCTGTCGAAGAAGGCGACCTGCAACTCCCACGGGCAAGATTCATCCTACTTCCTGGGATGGGAGGAGTACGAGAAGAATCCTTACGACCAACTCCATAATCCCAACGGAATCATTCAGATGGGTCTGGCGGAGAATCAGCTCTCCTTCGATCTGCTCGAATCATGGCTGGCCCAGAATCCAGACGCCGCCAGCTTCAAAAGAGACGGTCAGTCCATTTTCAGAGAGCTCGCTCTCTTCCAAGACTACCACGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784395.1
MTLSKKATCNSHGQDSSYFLGWEEYEKNPYDQLHNPNGIIQMGLAENQLSFDLLESWLAQNPDAASFKRDGQSIFRELALFQDYHGLPAFKNALVKFMSEIRGNKVKFEAKKLVLTAGATSANETLIFCLAEPGEAFLLPTPYYPGFDRDLKWRTGVEIVPIHCHSSNGFRITGPALEEAYQTAQKRNLKVKGVLVTNPSNPLGITLSRNELNLLVDFIDAKAIHLISDEIYSGTVFDSPSFVSIMEVLLNRNYVNTDVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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