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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002293`

染色体: Chr08 坐标: 21404160-21409481 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002293`
名称	SmilChr08G002293
描述	GTP-binding protein At3g49725, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21404160 - 21409481 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001819`
GeneID	`131001819`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001819`
原始查询	`SmilChr08G002293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein At3g49725, chloroplastic
产物	GTP-binding protein At3g49725%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G49725` (AT3G49725) GTP-binding protein, HflX [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922380] identity=54.3; qcov=0.917; evalue=1.71e-172; confidence=high
Rice	`Os03g0727900` - identity=56.9; qcov=0.916; evalue=5.08e-178; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF13167 (GTP-bdg_N); PF16360 (GTP-bdg_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001819

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784400.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784400.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784400.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784400.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21404400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:21404716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B38,B39,C46,C8
`Chr8:21405128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B66,B8
`Chr8:21405645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:21408987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B29,B95
`Chr8:21409094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784400.1

580 aa

290

580

GTP-bdg_N

GTP-bdg_M

MMR_HSR1

PF13167 GTP-bdg_N 119-184 aa PF16360 GTP-bdg_M 187-286 aa PF01926 MMR_HSR1 299-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784400.1`	Pfam	`PF13167`	GTP-bdg_N	Family	119	184	4.2e-12	47.2	GTP-binding GTPase N-terminal
`XP_057784400.1`	Pfam	`PF16360`	GTP-bdg_M	Family	187	286	8.2e-15	55.8	GTP-binding GTPase Middle Region
`XP_057784400.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	299	421	1.8e-18	67.4	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928417.1
TAAAAAGTGACACTATTTTTTATTGACACCTAAAATGATCAAAGCGTTGTACTTTTGGTTTTAGCATCGTTATTCCATCCAACAGGACCGATGCATAGAGAAATCACCGCCATTTTTGATTCTTCTGCGTTCACCGTTTTCCGGAGCAGCGGAAATCTGAATCTCGATCAGCTATACTTGAGAATTGTTCGATCAAACATATAATAAAGAAAGCTAAACATGCTAAGAAGCATTCTCCACTGGCGTTCCTCCCTACCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001819
ATGCTAAGAAGCATTCTCCACTGGCGTTCCTCCCTACCCCTCCATTCCACCCTAAACCCCATAAACCCTTCATCAACTTTGGATTTCTCAACAATACCATCTCAATTTTCCCCCTTTTTTCGCTATTTCTCGAATTCAAATCAAAATCAAGATGAAACATACAGGGACCCCGACGCCCCACCCCGGTTGTTCGTTGTACAGCCAAGGCTCCGGCCTCAAACCCATTTAAAGGTGAAGCTGGAGGAGGCGTTGTGTCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784400.1
MLRSILHWRSSLPLHSTLNPINPSSTLDFSTIPSQFSPFFRYFSNSNQNQDETYRDPDAPPRLFVVQPRLRPQTHLKVKLEEALCLADSLEQQRDEFSDMKFPDKEMPPHLVVQNPAAKSPRADTYFGLGTVETIRCHITNLEEKEEVDAIFVNATLRGIQQRNLERAWGKPVLDRVGLIIQIFNAHAQTKEAKLQAELAALMCKRSTLVRVRGPDGRHTFGGFGGSGEIEVVSARGRASGGRGFISGAGETEIQLQRRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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