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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002296`

染色体: Chr08 坐标: 21459883-21462049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002296`
名称	SmilChr08G002296
描述	receptor-like protein 44
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21459883 - 21462049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001823`
GeneID	`131001823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001823`
原始查询	`SmilChr08G002296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 44
产物	receptor-like protein 44
Arabidopsis	`AT3G49750` (RLP44) receptor like protein 44 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824137] identity=75.9; qcov=0.944; evalue=8.21e-140; confidence=high
Rice	`Os09g0131200` - identity=69.4; qcov=0.963; evalue=3.43e-108; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057784405.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784405.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784405.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784405.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21461012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,B88,C50
`Chr8:21461213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:21461246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:21461354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:21461486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B104,B114,C37
`Chr8:21461540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784405.1

268 aa

134

268

LRR_1

PF00560 LRR_1 94-116 aa PF00560 LRR_1 118-138 aa PF00560 LRR_1 143-162 aa PF00560 LRR_1 167-187 aa

XP_057784406.1

268 aa

134

268

LRR_1

PF00560 LRR_1 94-116 aa PF00560 LRR_1 118-138 aa PF00560 LRR_1 143-162 aa PF00560 LRR_1 167-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784405.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	94	116	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784405.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	118	138	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784405.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	143	162	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784405.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	167	187	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784406.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	94	116	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784406.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	118	138	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784406.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	143	162	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057784406.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	167	187	4.1e-15	53.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009094038.1
ACATGTGACCTATATATATACACTATACACCTCTATAATCATCAAATTAATATTCATGACATGCCAACACGCATCTCCATATTCCTATTTCAACACAAAAATAAACACAAGAAAAAGAAAAAGGCAGGCTAGTAATTACATTTGATTACTCCTCCACTTGGTATTGTATTGCATAGTGTATACCCCTCCAACATTAACACCATTATCTTAATCACCACCATCATCATCCTCTAAACCGCTCTGCCATTTCAACAAACACT...

XM_057928422.1
GCAGCTCTCTCACTTTCATCCATATTTTAAGTGTAGTGGTAGTGCTGCCCACCCACATGTGACCTATATATATACACTATACACCTCTATAATCATCAAATTAATATTCATGACATGCCAACACGCATCTCCATATTCCTATTTCAACACAAAAATAAACACAAGAAAAAGAAAAAGGCAGGCTAGTAATTACATTTGATTACTCCTCCACTTGGTATTGTATTGCATAGTGTATACCCCTCCAACATTAACACCATTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001823
ATGATGGGCATTATTTGGGGCTGGGTGGCCGCCGCGCTCCTCTTCTCCGCCGCCGCCGCCGATCCCAACGACGAGCGCTGCCTCACCCACCTCAGCCAGTCGCTGCAGGATCCCCTCAGGAATCTCCAGAACTGGACCAAGGACACCTTCGCCAGCCCTTGCCAGGGATTCACCTCCTTCCTCGAGGGCGCCACCTGCAACAACGGCCGCATCTACAAGCTCTCTCTCTCTAACCTCTCTCTCAAGGGCTCCATCTCCCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784405.1
MMGIIWGWVAAALLFSAAAADPNDERCLTHLSQSLQDPLRNLQNWTKDTFASPCQGFTSFLEGATCNNGRIYKLSLSNLSLKGSISPFLSNCTNLQALDLSSNQLSGPIPPDLQYLVNLAVLNLSANHLSGDIPQQLALCAYLNVIDLHDNQLSGLIPQQLGLLVRLSVFDVSNNKLSGPIPSSLGNRSGNLPRFNASSYAGNKGLYGYPLPPMKSSGLSVLAIVGIGLGSGLLSLVLSFTAVCVWLRVTDKKSENDEGK...

XP_057784406.1
MMGIIWGWVAAALLFSAAAADPNDERCLTHLSQSLQDPLRNLQNWTKDTFASPCQGFTSFLEGATCNNGRIYKLSLSNLSLKGSISPFLSNCTNLQALDLSSNQLSGPIPPDLQYLVNLAVLNLSANHLSGDIPQQLALCAYLNVIDLHDNQLSGLIPQQLGLLVRLSVFDVSNNKLSGPIPSSLGNRSGNLPRFNASSYAGNKGLYGYPLPPMKSSGLSVLAIVGIGLGSGLLSLVLSFTAVCVWLRVTDKKSENDEGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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