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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002299`

染色体: Chr08 坐标: 21506435-21506827 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002299`
名称	SmilChr08G002299
描述	uncharacterized SmilChr08G002299
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21506435 - 21506827 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998188`
GeneID	`130998188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998188`
原始查询	`SmilChr08G002299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.3; qcov=0.877; evalue=1.07e-09; confidence=low
Rice	`Os09g0545250` - identity=39.1; qcov=0.985; evalue=1.24e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779603.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779603.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779603.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779603.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21506467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:21506470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C46,D5,D7
`Chr8:21506472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C19,C43,C47
`Chr8:21506476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C46,D5,D7
`Chr8:21506483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	193	A1,A10,A14,A15,A2,A22,A24,A25,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B127,B129,B130,B131,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B5,B51,B52,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B71,B72,B74,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr8:21506485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C46,D5
`Chr8:21506496`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B115,B71,C31,C39,C62
`Chr8:21506510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B36
`Chr8:21506510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:21506513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C58
`Chr8:21506564`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	154	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B101,B105,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B122,B123,B124,B127,B13,B130,B132,B134,B135,B137,B138,B140,B16,B17,B20,B21,B23,B24,B25,B27,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B41,B43,B48,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B70,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C10,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C35,C37,C38,C39,C40,C42,C43,C45,C48,C49,C50,C53,C54,C55,C59,C60,C61,C64,C66,C67,C68,C70,C72,C73,C74,C81,C83,C85,C86,D1,D11,D2,D6,D7,D8
`Chr8:21506584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923620.1
ATGATTAATCTCGATAAATCCACGGTCTCTTTCAGCCCGAACACGAAGCAGAGTGATATTGATGGGGTGCTTGAACAGCTTGGCATTCGCGAAACACAGGGGCACGCCATGTACCTCGGCTTGCCCACGGTCATTCTTAAACAGAAGAAGATCCATTTTGAGTATTTGCGTGATCGGGTTTTTAAGAAACTACATGGTTGGGATAACAAATTCTTTTCAGCGGGAGGAAAAGAAGTTCTCATTAAATCGATCCTTCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998188
ATGATTAATCTCGATAAATCCACGGTCTCTTTCAGCCCGAACACGAAGCAGAGTGATATTGATGGGGTGCTTGAACAGCTTGGCATTCGCGAAACACAGGGGCACGCCATGTACCTCGGCTTGCCCACGGTCATTCTTAAACAGAAGAAGATCCATTTTGAGTATTTGCGTGATCGGGTTTTTAAGAAACTACATGGTTGGGATAACAAATTCTTTTCAGCGGGAGGAAAAGAAGTTCTCATTAAATCGATCCTTCAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779603.1
MINLDKSTVSFSPNTKQSDIDGVLEQLGIRETQGHAMYLGLPTVILKQKKIHFEYLRDRVFKKLHGWDNKFFSAGGKEVLIKSILQSIPTYAMACFRIPMGICSDIEKACCDFWWGVNDNGKNMYWASGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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