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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002304`

染色体: Chr08 坐标: 21706914-21707716 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002304`
名称	SmilChr08G002304
描述	phytosulfokines 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21706914 - 21707716 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001828`
GeneID	`131001828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001828`
原始查询	`SmilChr08G002304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytosulfokines 3-like
产物	phytosulfokines 3-like
Arabidopsis	`AT3G49780` (PSK4) phytosulfokine 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824140] identity=54.4; qcov=1.04; evalue=5.09e-21; confidence=medium
Rice	`Os03g0675600` (OsPSK5) - identity=44.9; qcov=0.908; evalue=1.09e-11; confidence=low
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0008083 (growth factor activity); GO:0008283 (cell population proliferation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06404 (PSK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057784414.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784414.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784414.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784414.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21707221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784414.1

76 aa

PSK

PF06404 PSK 26-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784414.1`	Pfam	`PF06404`	PSK	Family	26	76	5.4e-16	60.1	Phytosulfokine precursor protein (PSK)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928431.1
CCATTAATACTACCATAAATTCTACATTTTTCTTTGTACAATCATATATAAATTCTACAAGTTTTATTTAAAGATGTGAATCTTTCTCCCCACCAATGAATTGAATATAAAGTCTCCATTTTTATCGTCTGGGTTCACACTTGGCACATTTCACAATTTCCTCTCACACTCGTACTCATATAAATAGCCCACCATTTCTTTATCTTCCTCTTCATCTCACTCTCAAAAACAGAACCTTATACAAAAATGTCTAAAGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001828
ATGTCTAAAGCCACTACGTTTTTCGTTGTGCTCCTCCTCCTCTTCTCTCTCTCCTCTGCTGCTCGTCGCGCCCCCACCGCCAACGAGAGCGTGGAAGCCACAAATAAGGTTACTGAAGAAGGAACCCAAGTGGAAGATAGCTGCAAAGGAATTAGTGAAGATGAGTGTTTGATGAGAAGAACCCTCAACGCCCATACCGATTATATTTATACTCAGCAACATAACCCATGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784414.1
MSKATTFFVVLLLLFSLSSAARRAPTANESVEATNKVTEEGTQVEDSCKGISEDECLMRRTLNAHTDYIYTQQHNP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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