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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002314`

染色体: Chr08 坐标: 21810437-21815185 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002314`
名称	SmilChr08G002314
描述	heptahelical transmembrane protein 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21810437 - 21815185 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001836`
GeneID	`131001836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001836`
原始查询	`SmilChr08G002314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heptahelical transmembrane protein 4
产物	heptahelical transmembrane protein 4
Arabidopsis	`AT4G37680` (HHP4) heptahelical protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829922] identity=87; qcov=1; evalue=3.34e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0232900` (ADIPOR3) - identity=84.2; qcov=1; evalue=2.2e-137; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0038023 (signaling receptor activity)
KEGG	smil04081 (Hormone signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03006 (HlyIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057784423.1`
2	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057784423.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057784422.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057784422.1`
5	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057784423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21810859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B110,C20
`Chr8:21810931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B49,C25
`Chr8:21811063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:21811173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B132
`Chr8:21811186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:21811246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C14
`Chr8:21813061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59
`Chr8:21813073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59
`Chr8:21813133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:21813196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:21814567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784422.1

409 aa

204

409

HlyIII

PF03006 HlyIII 77-106 aa PF03006 HlyIII 209-394 aa

XP_057784423.1

215 aa

108

215

HlyIII

PF03006 HlyIII 15-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784422.1`	Pfam	`PF03006`	HlyIII	Family	77	106	2.1e-61	208.2	Haemolysin-III related
`XP_057784422.1`	Pfam	`PF03006`	HlyIII	Family	209	394	2.1e-61	208.2	Haemolysin-III related
`XP_057784423.1`	Pfam	`PF03006`	HlyIII	Family	15	200	1.7e-54	185.6	Haemolysin-III related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928439.1
CTTAAAATCGCGTCTTAGATGATGTCGGTCTTTGGCCCTCGGCCGAGAAAAATATCTTAGAAATGGTGCGAAATTCAAAACGAGGAATGCAAACACAGAATATTTTCAGCATCTCCGCATTTTTGTGAAGCGTCACTTTTCTCCTCCATCACCATTCACCACGTATTTATTTTCATTTCACAATTAATTATTATTCCATCTCCATAAATGCCAAAACGAATTTGCTCAATTGCAGATTTCTGTTGCATCATTAATTAGCG...

XM_057928440.1
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTTCTTTGGCATTTAATGCTCCTGAAAATAAAGTCATATAGTGTTGTGTCTAATGAGCACCTCGTCTTAAAGCTTAAGCAGACACTATACTTTGACATTTAGCTTTCTATCTTCATCACACCCTCTTATGTGCAAGCAGGTTACCTTGTCTAAAGCCTTACGCATAGAAACTTCTATTAATGGGTGGCGCACAGATTTTGACCTCATACTTTCGGTTTAGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001836
ATGGGTAAGAATGAAGGAAATCGTGGTGCGGTGAAATCGTGCGGTGGATCGGATGAGAATTTGATATCGCGTTCTTCGTCGGGAGACGGGAAAGGAAAGAGATTGTGGAAGAAGGTGAAATACCAGCTGGTGGAGTACCACGCGCTGCCCGGATATTTGAAGGATAATGAGTATATCCTTGGTCATTACAGGGCTGAATGGCCTTTGAAGCAGGCCCTGCTCAGCGTTTTCTCCATTCACAATGAGACCCTCAACGTTTG...

LOC131001836
ATGAAAGAGGATGTGGCGAACATAATAGCTCCTTTGCTGGTGAGGCCAATCACACGTTGGCCGTTCTTTGCTTTCTTGGGTGGGGCTATGTTCTGCTTGTTAGCCAGCAGCACATGCCACTTGCTCTCCTGCCACTCCGAACGCGTAGCTTACATCATGCTTCGGCTCGACTATGCTGGGATCGCCGCCCTTATCTCAACATCCTTCTACCCGCCCGTTTACTACTCCTTCATGTGCTATCCTTTCTTCTGCAATCTCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784422.1
MGKNEGNRGAVKSCGGSDENLISRSSSGDGKGKRLWKKVKYQLVEYHALPGYLKDNEYILGHYRAEWPLKQALLSVFSIHNETLNVWTHLIGFFLFLSLTIYTAMKVPNVVDLNLPSALRNADFQKLHAELITCLPSLPHMPDLQRFREELKTSLPSMNLSPYLSNWHIMELLSNCLPENLTHSNHTDTCVLHSMKEDVANIIAPLLVRPITRWPFFAFLGGAMFCLLASSTCHLLSCHSERVAYIMLRLDYAGIAALIS...

XP_057784423.1
MKEDVANIIAPLLVRPITRWPFFAFLGGAMFCLLASSTCHLLSCHSERVAYIMLRLDYAGIAALISTSFYPPVYYSFMCYPFFCNLYMGFITVLGIGTILASLLPVFQSPEYRTFRASLFFGMGFSGAAPILHKLILFWHQPEALHTTGYEVLMGLFYGIGALVYAMRIPERWMPGKFDIAGHSHQLFHVLVVAGAFTHYRAGLVYLRWRDLQGC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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