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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002320`

染色体: Chr08 坐标: 21858579-21859419 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002320`
名称	SmilChr08G002320
描述	uncharacterized SmilChr08G002320
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21858579 - 21859419 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001843`
GeneID	`131001843`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001843`
原始查询	`SmilChr08G002320`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G37660` (AT4G37660) Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920] identity=60.8; qcov=0.894; evalue=4.84e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0734400` (OSJNBa0027J18.14) - identity=45; qcov=0.875; evalue=5.61e-29; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00542 (Ribosomal_L12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001843

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784445.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057784445.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784445.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784445.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784445.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21858808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:21859078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B105,B133,B15,D4
`Chr8:21859083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B133
`Chr8:21859086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B133
`Chr8:21859091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B105,B15
`Chr8:21859099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B133
`Chr8:21859110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C59,C81
`Chr8:21859170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B133
`Chr8:21859242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:21859249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784445.1

160 aa

160

Ribosomal_L12

PF00542 Ribosomal_L12 93-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784445.1`	Pfam	`PF00542`	Ribosomal_L12	Domain	93	159	8.6e-24	84.4	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928462.1
AATTTCATCAAGTAAATAATAAATAAATAAAATAATAAACCACATCTGTCCATTTTAGAACCTTAAACCCAACTGGTAGCTCACAGTCCTCTTCGTTTCTCAAATGCCACTCTGAAAACCCCCAAAATTTCCCTATCCACAATGGCCTCAATATTTCCAAAAATCCCCTCCAGCTCCCTCGCTCGGTCGCTCTTCCACCGGGCTCTCTGCACCGCCGCGGAGACTCGAACCCAAAAGCTCGAACGAATCGCTGAGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001843
ATGGCCTCAATATTTCCAAAAATCCCCTCCAGCTCCCTCGCTCGGTCGCTCTTCCACCGGGCTCTCTGCACCGCCGCGGAGACTCGAACCCAAAAGCTCGAACGAATCGCTGAGGAGCTGATTGGCCTCAACAAGATCGAGCGCCATGATTACGTTATACTATTTCGTCATAAAATGGGCTTGAATCGGTTCGGCGCCGCCGCCTCCGCACCCGCCGCCCAATCGCCTTCATCAGCCGCCTCATCTGCCCCTGCTGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784445.1
MASIFPKIPSSSLARSLFHRALCTAAETRTQKLERIAEELIGLNKIERHDYVILFRHKMGLNRFGAAASAPAAQSPSSAASSAPAAAKEKTAFDVKLEKFEASAKLKVIKEIRSFTDLGLKEAKDLVEKTPAVVKKGVTKEEADKIVAKLKEIGATVVLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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