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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002323`

染色体: Chr08 坐标: 21888815-21892151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002323`
名称	SmilChr08G002323
描述	ADP-ribosylation factor-like protein 8a
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21888815 - 21892151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001846`
GeneID	`131001846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001846`
原始查询	`SmilChr08G002323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor-like protein 8a
产物	ADP-ribosylation factor-like protein 8a
Arabidopsis	`AT3G49870` (ARLA1C) ADP-ribosylation factor-like A1C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824149] identity=93.5; qcov=1; evalue=2.26e-127; confidence=high
Rice	`Os03g0200800` (OsARL1a) - identity=88; qcov=1; evalue=4.44e-122; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0015031 (protein transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF04670 (Gtr1_RagA); PF08477 (Roc); PF09439 (SRPRB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057784450.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057784450.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057784450.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057784450.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057784450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21889103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:21889964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784450.1

184 aa

184

Arf

Roc

SRPRB

MMR_HSR1

Ras

Gtr1_RagA

PF00025 Arf 9-178 aa PF08477 Roc 22-132 aa PF09439 SRPRB 22-146 aa PF01926 MMR_HSR1 23-130 aa PF00071 Ras 23-179 aa PF04670 Gtr1_RagA 24-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	9	178	1.7e-46	158.6	ADP-ribosylation factor family
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	22	132	1.1e-15	58.6	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF09439`	SRPRB	Domain	22	146	4.7e-08	33.3	Signal recognition particle receptor beta subunit
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	23	130	2.1e-07	31.7	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	23	179	1.3e-17	64.6	Ras family
`XP_057784450.1`	Pfam	`PF04670`	Gtr1_RagA	Domain	24	144	3.4e-09	37.2	Gtr1/RagA G protein conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928467.1
AGCCAATGAGGAGTAGCCAATAAGACACGGGGCACACGTCAGGTTTCAAGCAACGTGCAGCCACGACCAGTAGCGCGTGGATATCACCGCCCAATCAGCAACATACACAACTCCAACATATATTAGCACTGAGGCACACGCGTTAACAGCGCGAGTGAAACTGGAGGGTTGCCTTTTTGCCACCCCATTTTCATGATTGGTCCACCGATAATCAATCACACAGCGAGAAATAGCTGCCCGCCCCAAAAAATCCGCGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001846
ATGGGTCTCTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTAGAAGCCTTTTCTTCAAGCAAGAAATGGAACTGTCACTTATAGGTCTTCAGAATGCTGGAAAAACTTCGCTTGTAAATGTTGTCGCTACTGGTGGATACAGTGAAGATATGATCCCTACGGTAGGATTTAATATGCGGAAAGTCACAAAAGGCAATGTCACAATAAAGCTGTGGGATCTTGGAGGTCAGCCCAGATTTAGGAGTATGTGGGAGCGGTATTGCCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784450.1
MGLWEAFLNWLRSLFFKQEMELSLIGLQNAGKTSLVNVVATGGYSEDMIPTVGFNMRKVTKGNVTIKLWDLGGQPRFRSMWERYCRAVSAIVYVVDAADPDNISISKSELHDLLSKPSLSGIPLLVLGNKIDKNMALSKQALTDQMGLKSITDREVCCFMISCKNSTNIDQVIDWLVKHSKSKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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