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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002334`

染色体: Chr08 坐标: 21976596-21982888 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002334`
名称	SmilChr08G002334
描述	uncharacterized SmilChr08G002334
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21976596 - 21982888 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001853`
GeneID	`131001853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001853`
原始查询	`SmilChr08G002334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842804]; symbol=HEB1; hit=AT1G64960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842804]; symbol=HEB1; hit=AT1G64960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G64960` (HEB1) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842804] identity=48; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0616500` - identity=42; qcov=0.635; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000070 (mitotic sister chromatid segregation); GO:0000796 (condensin complex); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF12422 (Condensin2nSMC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784459.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057784459.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784459.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784459.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784459.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21976802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D4
`Chr8:21976928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:21977215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:21977234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:21977242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B29,B95,C32,C68
`Chr8:21977321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D4
`Chr8:21977557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B27,B42,B43,C13
`Chr8:21977603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:21977605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C83
`Chr8:21978070`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,B105,B109,B118,B12,B139,B18,B44,B52,B72,B73,B82,C43,C58,C70,C75,C86,D11,D6
`Chr8:21978109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D4
`Chr8:21978215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784459.1

1227 aa

614

1227

Condensin2nSMC

PF12422 Condensin2nSMC 223-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784459.1`	Pfam	`PF12422`	Condensin2nSMC	Family	223	370	2.3e-53	181.0	Condensin II non structural maintenance of chromosomes subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928476.1
AATCCAGTGACCGCGGAAGCGAAGTTCAAATATTCAAAATGCTCTGGGGTGGTGGGGATGCCGCTAAAGCCAGATTTTCAGATATCCAGTAACAGACGAATTGTGGTACGATCCAAAACCATTTTTCATCCCCTTCATTGGTTTGTGATACTGCAAGCAGCATCCGAAATCAATGGATAAACGACTCCGTTCGTCTCTGCAATCCTCCGCCGAAGAGTTCCTGTCGGCCGCCGCCAAATTACCGCTAAGATCTTCCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001853
ATGGATAAACGACTCCGTTCGTCTCTGCAATCCTCCGCCGAAGAGTTCCTGTCGGCCGCCGCCAAATTACCGCTAAGATCTTCCAAAGCCACCATTAAAAGCTCGATTAACACCTTAATCAAACCCTCGTCAGATCTAATCTCCACTCTCCCCTTCTCTCTCCGCGATTCCATTTCGCGCGCCATTTCTAAATTCAAACATCTCTCCGACTCGACTTTCGCGGCGTCTCCCTTGACGCCTCCGGCGAAGCGTGTCCGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784459.1
MDKRLRSSLQSSAEEFLSAAAKLPLRSSKATIKSSINTLIKPSSDLISTLPFSLRDSISRAISKFKHLSDSTFAASPLTPPAKRVRRSARNKKDDDGENEGPSTAEKLQVYAYILHLCVFHPNNVFSVSDLLPAAQELHDNLILFESDSTLLSEIANLCEEWWKVGLLGKETLISQSLPVILSRSLTSKKKVDVHRVYSLREAFSLFDFEDESIEDLKNLLIRCVISDLYLKTEDGRKFIAFLFGLSMQLTKELCAMIKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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