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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002335`

染色体: Chr08 坐标: 22002474-22004290 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002335`
名称	SmilChr08G002335
描述	cyclin-D5-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22002474 - 22004290 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001855`
GeneID	`131001855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001855`
原始查询	`SmilChr08G002335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-D5-1-like
产物	cyclin-D5-1-like
Arabidopsis	`AT4G37630` (CYCD5;1) cyclin d5;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829917] identity=34.9; qcov=1.04; evalue=3.75e-48; confidence=low
Rice	`Os03g0617500` (CycD5) - identity=48.3; qcov=0.672; evalue=7.61e-44; confidence=medium
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784462.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784462.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784462.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784462.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22002905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B88
`Chr8:22003064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:22003457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:22003490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C1
`Chr8:22003517`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A16,A25,A6,A9,B103,B110,B118,B120,B13,B130,B14,B18,B19,B33,B4,B41,B60,B72,B79,B82,B84,B90,B92,B94,C12,C13,C14,C18,C2,C20,C21,C29,C34,C37,C54,C57,C63,C77,C84,D4
`Chr8:22003586`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,B58
`Chr8:22003586`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B140,B58
`Chr8:22003632`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	138	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B103,B104,B107,B108,B109,B110,B113,B115,B117,B119,B12,B123,B127,B13,B130,B134,B135,B137,B138,B14,B17,B18,B23,B26,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B50,B51,B54,B56,B57,B60,B62,B63,B64,B7,B72,B78,B79,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C13,C14,C17,C18,C19,C21,C27,C28,C30,C34,C35,C37,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C68,C69,C70,C72,C73,C76,C78,C8,C80,C83,C84,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D8
`Chr8:22004085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784462.1

308 aa

154

308

Cyclin_N

PF00134 Cyclin_N 65-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784462.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	65	167	6e-22	78.4	Cyclin, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928479.1
ATTTACAAACTAGAAAATTATTGGAACAACCATTATATAAGTTCTCTCACTACCACCTCCCAAATTTGGCGCCACCTCCTTCTTCTCTCTCTTCCCACTCCCACCATCTGCACTTTCTCACTCACTCTAACTACAACTCCAACACACAAAACTTGCGATGGTGGAGGATTTCCAGAACTCGTTCTCCACCCTTCTCTGCGGGGAAGATGAATCCTGTTTCGACCATTTCAAAGACGAACGCTTCAATGTCCATTTCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001855
ATGGTGGAGGATTTCCAGAACTCGTTCTCCACCCTTCTCTGCGGGGAAGATGAATCCTGTTTCGACCATTTCAAAGACGAACGCTTCAATGTCCATTTCAATTTCTCTCCCGTCTCCCAATTTGATTCTGAATACATCCAAATGTTAATCCGAAACGAAACCAAATATTCAGTAAAAATCGAAGGAAGCTGGTGGAAGCGCCCGCGACGAGATGCCGTCAAATGGATTCTCGATAGAAGGGCTCATTTCGGATTTCAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784462.1
MVEDFQNSFSTLLCGEDESCFDHFKDERFNVHFNFSPVSQFDSEYIQMLIRNETKYSVKIEGSWWKRPRRDAVKWILDRRAHFGFQCRTAYLSLFYLDRFLSRRSIDKEKPWAIRLLSIACLSLAAKMEECEAPWLSEYDADEYSFDGEVIQRMELLVLNTLEWKMSGITPFTYLNYFATLFCFQFRLNRAVDLILAIMAEINVMDHRPSVVAAAAVLAACDDHLTNKMLEIKIDAVPSWGALEKEHTLLCYSLLQEIGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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