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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002336`

染色体: Chr08 坐标: 22007038-22012153 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002336`
名称	SmilChr08G002336
描述	uncharacterized SmilChr08G002336
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22007038 - 22012153 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998194`
GeneID	`130998194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998194`
原始查询	`SmilChr08G002336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779608.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779608.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779608.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779608.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779608.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22007071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B101,B14
`Chr8:22007071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B14
`Chr8:22007072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C58,C80
`Chr8:22007075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B91,D6,D7
`Chr8:22007178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B140,B51,C25,C86,D1,D4
`Chr8:22007181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B140,B51,C25,C86,D1,D4
`Chr8:22007192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C44,C45,C54
`Chr8:22007200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:22007241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B23,B35,B93,C1
`Chr8:22007245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C38,D4
`Chr8:22007275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C86
`Chr8:22007288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,C1,C61,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779608.1

402 aa

201

402

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 182-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779608.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	182	313	2.6e-14	54.3	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923625.1
ATGGAAATCTTTCAATTTCCTCTCTGCAGCGGCCGACGGCAAGAGGTGGTGGGCGAGAGCCGGAGGCGGAGGGCAGAGGCGGCGTTGGAGCCTGCGGAGGCGCGAGGCGGCGGAGGCGTTGGAAGCGAAGCAAGAGGATGGTGGAGGCGGCGCAGGAAGATGGTGGCGAAGGCGCGAGGCGCCGGAGGTGCCAGGCGGTGGAAGAAGGCGGAGGGCAGCGGCTGTTGCGGCAGAGGCGGCATTGGAGCCCGCAGAGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998194
ATGGAAATCTTTCAATTTCCTCTCTGCAGCGGCCGACGGCAAGAGGTGGTGGGCGAGAGCCGGAGGCGGAGGGCAGAGGCGGCGTTGGAGCCTGCGGAGGCGCGAGGCGGCGGAGGCGTTGGAAGCGAAGCAAGAGGATGGTGGAGGCGGCGCAGGAAGATGGTGGCGAAGGCGCGAGGCGCCGGAGGTGCCAGGCGGTGGAAGAAGGCGGAGGGCAGCGGCTGTTGCGGCAGAGGCGGCATTGGAGCCCGCAGAGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779608.1
MEIFQFPLCSGRRQEVVGESRRRRAEAALEPAEARGGGGVGSEARGWWRRRRKMVAKARGAGGARRWKKAEGSGCCGRGGIGARRGARRHRRWRRSRRKVEALQEDGGGGVRMLRLFAVDQEVGLTYAQKLASTTRGRGHVEGKNEDMNEARVAYKDYISACKKTLLLHKKKIDSLNPIVEAAWRAYWALPETQAKSAQASKNRRSEPCGVGTGMAIHHGGSRSALDHAEHLARESNIPFDAASWATFRRIHFKNGQYTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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