当前解析结果
SmilChr08G002361| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002361 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002361 |
| 描述 | 2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent) |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 22369952 - 22372039 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001884 |
|---|---|
| GeneID | 131001884 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001884 |
| 原始查询 | SmilChr08G002361 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent) |
| 产物 | 2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent) |
| Arabidopsis | AT1G65560 (AT1G65560)Zinc-binding dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842867] identity=67.54; qcov=0.977; evalue=4.63e-176; confidence=high |
| Rice | Os01g0891300- identity=67.15; qcov=0.969; evalue=1.17e-170; confidence=high |
| GO | GO:0016628 (oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, NAD or NADP as acceptor) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00107 (ADH_zinc_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2); PF16884 (ADH_N_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001884 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057784498.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057784498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:22370210 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr8:22370705 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057784498.1PF16884
ADH_N_2 12-124 aa
PF00107
ADH_zinc_N 171-292 aa
PF13602
ADH_zinc_N_2 204-346 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057784498.1 |
Pfam | PF16884 |
ADH_N_2 | Family | 12 | 124 | 1e-24 | 87.2 | N-terminal domain of oxidoreductase |
XP_057784498.1 |
Pfam | PF00107 |
ADH_zinc_N | Domain | 171 | 292 | 4.9e-23 | 82.2 | Zinc-binding dehydrogenase |
XP_057784498.1 |
Pfam | PF13602 |
ADH_zinc_N_2 | Domain | 204 | 346 | 9.5e-08 | 33.7 | Zinc-binding dehydrogenase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。