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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002377`

染色体: Chr08 坐标: 22558571-22565170 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002377`
名称	SmilChr08G002377
描述	wall-associated receptor kinase-like 9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22558571 - 22565170 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998201`
GeneID	`130998201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998201`
原始查询	`SmilChr08G002377`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase-like 9
产物	wall-associated receptor kinase-like 9
Arabidopsis	`AT1G69730` (AT1G69730) Wall-associated kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843309] identity=33.9; qcov=0.626; evalue=2.74e-56; confidence=low
Rice	`Os11g0448200` - identity=57.4; qcov=0.645; evalue=4.33e-132; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF19160 (SPARK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779614.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779614.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779614.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779614.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22558621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:22558873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B40,C28,C43,C58
`Chr8:22558968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22559137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B108,B12,C85
`Chr8:22559186`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:22559186`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:22559421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A18
`Chr8:22559421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:22559651`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr8:22559651`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr8:22559672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr8:22559674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779614.1

546 aa

273

546

SPARK

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF19160 SPARK 12-157 aa PF00069 Pkinase 273-529 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 274-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779614.1`	Pfam	`PF19160`	SPARK	Domain	12	157	2.9e-08	35.0	SPARK
`XP_057779614.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	273	529	8e-47	160.5	Protein kinase domain
`XP_057779614.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	274	466	3.8e-42	145.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923631.1
ATGGGTCCTACAAATGGTGGCGATGATGCATTTGCAGCGTGCAGTTTAAACTTCACTTCATTCCCCTACAAACCTATGGGTGGATGCACCCACATTGACGAGGCGTTGGGCGACTGGAACGGCTACCCTAAGTCGAGTTGTTGTCAACACGCGCTGGCCTTTTTCGCTCACGCACTCGCCCTCCATGCAGCGGGTGGCGCCATCTTCATCCCCCGCTCGCAGTGGAACGACTGCAGCGGGCCTCTCCCGCTGCAGCCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998201
ATGGGTCCTACAAATGGTGGCGATGATGCATTTGCAGCGTGCAGTTTAAACTTCACTTCATTCCCCTACAAACCTATGGGTGGATGCACCCACATTGACGAGGCGTTGGGCGACTGGAACGGCTACCCTAAGTCGAGTTGTTGTCAACACGCGCTGGCCTTTTTCGCTCACGCACTCGCCCTCCATGCAGCGGGTGGCGCCATCTTCATCCCCCGCTCGCAGTGGAACGACTGCAGCGGGCCTCTCCCGCTGCAGCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779614.1
MGPTNGGDDAFAACSLNFTSFPYKPMGGCTHIDEALGDWNGYPKSSCCQHALAFFAHALALHAAGGAIFIPRSQWNDCSGPLPLQPGVSIRTCGFDDFYYGSSKCSTLHVTRIDGHVVERCSLFGNSSFDDACGSCTSAISDEVENLLADLEAQGSHVEEAVCRVAVVVALMARTPVIGSADLHNCLPALTASEPAENYIKLNDGVAGALFAVILVILGLGVVIKHVAKKSNEEKKMMKKKNKVGLSKELATKCSGLYRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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