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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002378`

染色体: Chr08 坐标: 22565363-22568000 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002378`
名称	SmilChr08G002378
描述	U-box domain-containing protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22565363 - 22568000 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001896`
GeneID	`131001896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001896`
原始查询	`SmilChr08G002378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 9-like
产物	U-box domain-containing protein 9-like
Arabidopsis	`AT3G07360` (PUB9) plant U-box 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819924] identity=42.9; qcov=0.985; evalue=1.09e-102; confidence=medium
Rice	`Os02g0488600` (OsPUB8) - identity=43; qcov=0.841; evalue=1.86e-90; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF04564 (U-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784513.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057784513.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057784513.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784513.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22565683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:22566018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B100,B91
`Chr8:22566048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B78,C21,C44
`Chr8:22566462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22566537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22567226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B40,C28,C43,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784513.1

459 aa

230

459

U-box

Arm

PF04564 U-box 71-139 aa PF00514 Arm 287-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784513.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	71	139	1.8e-17	64.0	U-box domain
`XP_057784513.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	287	324	1.8e-07	31.7	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928530.1
AACACATTTTCAAAACAAATTAGAGAAACACACAATTATAAAATGAAATCAATCATTCTATTCTATTAAGTTCGATCAATTAATTATCTTGGTTTCACTTTGTTTGCTTCAATTTACAAAAATCAAACAAAATCAATCTCATTTAATAACAAGAAGTTTGATCTGATTCGAATTTAAAATATTTTCATCTAATTCAGTCAGTATCATGCATATCCATAAGCGATTCATTCAAGTGACTTAAATTATTTACTTGTTTTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001896
ATGGAGAAAATTGCAGGAAAAGAGACGGCTTTGGAGCTGAAGAAAGAGCTGCAGAGAGTGACGGAAGCCCTGATGGTAGACGATGATGATGATTTGGAGATTACTGATTATGCAATTCAGACATTGTGTGCCCTAAAGGAATTGAAGCTGAAACAGAGTGATTTTGATCAGGGGTTTATGAAGTTGAAGAATCTCGAATTCCAAGAACCACCTCAAGAATTTCGGTGCCCAATTTCTGGGATTTTGATGAAAGACCCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784513.1
MEKIAGKETALELKKELQRVTEALMVDDDDDLEITDYAIQTLCALKELKLKQSDFDQGFMKLKNLEFQEPPQEFRCPISGILMKDPVVAASGQTFEELSIRKWLNEGNTKCPQTHQLLPHTLLIPNYSIKNMIINWCKATSRGDAPRTSPTRADELGANVSREHQMELLERLSSSSLPDQMAAVKELRLLTARLPSARSLFGEINGATSLLLSPLLVERCYSDAALYEDVVATILNISTDHSCKMKILEGRSTSAVSFLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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