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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002380`

染色体: Chr08 坐标: 22588326-22592258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002380`
名称	SmilChr08G002380
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22588326 - 22592258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001898`
GeneID	`131001898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001898`
原始查询	`SmilChr08G002380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29.6; qcov=0.639; evalue=6.85e-24; confidence=low
Rice	`Os08g0202400` - identity=29.3; qcov=0.877; evalue=4.21e-29; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057784515.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784515.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784515.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784515.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22589096`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	120	A1,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A25,A7,B105,B106,B107,B109,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B123,B126,B128,B133,B134,B136,B138,B14,B15,B16,B18,B19,B21,B22,B23,B26,B28,B31,B33,B36,B37,B38,B39,B41,B47,B49,B50,B52,B53,B55,B59,B60,B64,B65,B71,B72,B75,B76,B77,B81,B82,B83,B87,B89,B90,B92,B93,B97,B99,C11,C13,C15,C18,C19,C2,C20,C22,C25,C27,C29,C3,C31,C34,C35,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C53,C55,C57,C59,C60,C69,C70,C72,C74,C77,C79,C80,C81,C83,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D7,D8
`Chr8:22591024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22591084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22591096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B22,B53
`Chr8:22591100`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:22591100`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22591103`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:22591103`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22591138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A19,B46,C62,C72
`Chr8:22591145`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A14,A19,B46,C62,C72
`Chr8:22591145`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A14,A19,B46,C62,C72
`Chr8:22591191`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A14,A19,B105,B46,B69,B82,C24,C58,C62,C72,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784515.1

413 aa

206

413

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 146-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784515.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	146	308	3e-33	115.5	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928532.1
ATAAACACTAACTAACATTTGTCTGTGAAATGTTGCTTTCCTTCAACTAAATTAGATTATTTCCGCAGCCGGCACATATTAATTTTTTATAAGAATTGTTGGATTAAACAATTGAGCAGGTATTGTTTTACTCTAATTTTCCTCCACCACTTTCACCATTACCAACTCCTTCCGCTGCCACCACCACCACCAACTCTCAGATCAGAGGAATGACAACTTATGGTGCAATCATTTCTCTTAAGAATACGATTCAGTATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001898
ATGACAACTTATGGTGCAATCATTTCTCTTAAGAATACGATTCAGTATATTCTCCATTCTTCTCATATTATTAGCCTTCTTGATCCCTCCCTACATATCACACAGCTTGCGTACAAGGAGTTGCAGCCCTTCCAAGAAATTCTGGAAAAATTGGATAACACTAGCAAAAGCAGTAGCAGGAAGAAGGTGAATGCTTTGGATGGACGAATCAAAGAGGCACTATGGAAATTTGAAGACTTATTGGAATCAATTCACTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784515.1
MTTYGAIISLKNTIQYILHSSHIISLLDPSLHITQLAYKELQPFQEILEKLDNTSKSSSRKKVNALDGRIKEALWKFEDLLESIHSDLQSPLDRLRDDVDSFIHTLKDMEREYLYELQNMLEDDDEPISSIIGFGGRKSKMIGLSYQIEQVKSDVMQEYNWKHVYALVGMAGVGKTTLAKEIFEDPQISSHFECRAWVTVGRKPQLTQLLQGILAQLCGITQGDDIIGDYLKGKKCLIVVDDVWETHVLNSLISSLPDIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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