当前解析结果
SmilChr08G002386| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002386 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002386 |
| 描述 | golgin-84-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 22633978 - 22636049 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001904 |
|---|---|
| GeneID | 131001904 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001904 |
| 原始查询 | SmilChr08G002386 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | golgin-84-like |
| 产物 | golgin-84-like |
| Arabidopsis | AT2G19950 (GC1)golgin Putative 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816514] identity=71.6; qcov=0.826; evalue=2.28e-42; confidence=medium |
| Rice | Os01g0744400- identity=69.7; qcov=0.861; evalue=2.52e-43; confidence=medium |
| GO | GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0000301 (retrograde transport, vesicle recycling within Golgi); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0031985 (Golgi cisterna) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001904 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057784522.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057784521.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.40000 | XP_057784521.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057784522.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784521.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:22634396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C87,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。