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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002394`

染色体: Chr08 坐标: 22711383-22712915 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002394`
名称	SmilChr08G002394
描述	uncharacterized SmilChr08G002394
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22711383 - 22712915 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001913`
GeneID	`131001913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001913`
原始查询	`SmilChr08G002394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=25.9; qcov=0.656; evalue=7.62e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784542.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784542.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784542.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784542.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22712155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B22,B27,B41,B45,B74,B77,C16
`Chr8:22712168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B65,B69,B89
`Chr8:22712221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B65,B69,B89
`Chr8:22712228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22712266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22712273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr8:22712300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B65,B69,B89
`Chr8:22712353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B65,B69,B89
`Chr8:22712405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A19
`Chr8:22712405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:22712449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C29
`Chr8:22712449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784542.1

282 aa

141

282

DUF8566

PF29561 DUF8566 77-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784542.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	77	278	7.2e-50	170.3	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928559.1
ATATATATTTTCTGAGGTATACTTCGACTCCGATGGGTCCTAAACGCCAGCGTAAATCCGGAAACATCAATAATGCTGAGATTGGGGATAAGAGATCAAGACAAATTAGTGATGATGATGACTTTGTTAGTTATGACATGTTAGGCCAAGAACAAGATGCAACAATGAGGTTCAATTTGGTGAAGGAGAAAAGAAGCAACGAAGCTAATGAAGAAGATAGCAACAATGAGGTTGAGTTTGGTGTGTTCCCTATGTTGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001913
ATGGGTCCTAAACGCCAGCGTAAATCCGGAAACATCAATAATGCTGAGATTGGGGATAAGAGATCAAGACAAATTAGTGATGATGATGACTTTGTTAGTTATGACATGTTAGGCCAAGAACAAGATGCAACAATGAGGTTCAATTTGGTGAAGGAGAAAAGAAGCAACGAAGCTAATGAAGAAGATAGCAACAATGAGGTTGAGTTTGGTGTGTTCCCTATGTTGGCCTGCAGAACAAACCCACAAGTTCTGGTAAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784542.1
MGPKRQRKSGNINNAEIGDKRSRQISDDDDFVSYDMLGQEQDATMRFNLVKEKRSNEANEEDSNNEVEFGVFPMLACRTNPQVLVNTIEKMNNIQKREIIDMGFGHILSLRVKEVPSMLGYWLLDNFNPITCEISLQDGRKLHIEHNDVYRVFGFPKGKRIIKKKKKQEHHELLNEWKKFFPGKEHKILPVDVSNEALRHIDGGIWFRRQFMILLTICLIENGSNGYVTPQIMRCFEDVSQLVVWDWCEFVFRCLVDHKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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