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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002397`

染色体: Chr08 坐标: 22752417-22756783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002397`
名称	SmilChr08G002397
描述	LOB domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22752417 - 22756783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001915`
GeneID	`131001915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001915`
原始查询	`SmilChr08G002397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 1-like
产物	LOB domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G07900` (LBD1) LOB domain-containing protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837305] identity=53.75; qcov=0.824; evalue=6.18e-55; confidence=high
Rice	`Os03g0287400` - identity=62.7; qcov=0.741; evalue=2.25e-51; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001915

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784544.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22752472`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,B34,B45,B96,C53,C54,C6,C78,C84,C85
`Chr8:22752477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:22752479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:22752551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B135,C61,C62
`Chr8:22752594`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr8:22752594`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr8:22756353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B140,B95,C4,C46
`Chr8:22756408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B64
`Chr8:22756460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C82
`Chr8:22756466`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A22,B58
`Chr8:22756466`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A22,B58
`Chr8:22756491`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784544.1

170 aa

170

LOB

PF03195 LOB 35-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784544.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	35	131	5.4e-39	133.5	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928561.1
ATGCATCAGCCCACCACCACCTCCGCCGCCGCCACGGTGGTCCTAGAGGCGGGACATTGGCCGTCTCTGACATTGCCAGCTTCGTCAGCGATCCTCACTCTGTGCGCTGCTTGCAAGACCCTCCGCCGCCGCTGCGTTGAGAAATGCATGCTGGCGCCCTACTTCCCTCCCGATGAACCTCTCAAGTTCGCCATTGCTCACCGGATTTTCGGAGCCAGCAACATTATTAAGCTGTTGCAGGAAGTTGGAGAAGGTGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057784544.1_43471
ATGCATCAGCCCACCACCACCTCCGCCGCCGCCACGGTGGTCCTAGAGGCGGGACATTGGCCGTCTCTGACATTGCCAGCTTCGTCAGCGATCCTCACTCTGTGCGCTGCTTGCAAGACCCTCCGCCGCCGCTGCGTTGAGAAATGCATGCTGGCGCCCTACTTCCCTCCCGATGAACCTCTCAAGTTCGCCATTGCTCACCGGATTTTCGGAGCCAGCAACATTATTAAGCTGTTGCAGGAAGTTGGAGAAGGTGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784544.1
MHQPTTTSAAATVVLEAGHWPSLTLPASSAILTLCAACKTLRRRCVEKCMLAPYFPPDEPLKFAIAHRIFGASNIIKLLQEVGEGERADAVNSMVYEANARLRDPIYGCAGAICHLQKQIDHLQIQLATAHAQILNLQCHNAILQNQFCKTQQPSLDDEGILGVGDPLWT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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