当前解析结果
SmilChr08G002413| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002413 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002413 |
| 描述 | photosystem II 5 kDa protein, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 22917547 - 22918294 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001932 |
|---|---|
| GeneID | 131001932 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001932 |
| 原始查询 | SmilChr08G002413 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | photosystem II 5 kDa protein, chloroplastic-like |
| 产物 | photosystem II 5 kDa protein%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT1G51400 (AT1G51400)Photosystem II 5 kD protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841564] identity=56.3; qcov=1.03; evalue=6.74e-24; confidence=medium |
| Rice | Os02g0581100- identity=76; qcov=0.25; evalue=3.3e-09; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001932 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057784563.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057784563.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.80000 | XP_057784563.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784563.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784563.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:22917785 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr8:22917786 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B26,B48,B68,C77,D6 |
Chr8:22917792 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B119,C26 |
Chr8:22917916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B81 |
Chr8:22917917 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B57 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。