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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002426`

染色体: Chr08 坐标: 23031041-23034969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002426`
名称	SmilChr08G002426
描述	uncharacterized SmilChr08G002426
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23031041 - 23034969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001946`
GeneID	`131001946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001946`
原始查询	`SmilChr08G002426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tryptophan/tyrosine permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832070]; symbol=AT5G19500; hit=AT5G19500; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Tryptophan/tyrosine permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832070]; symbol=AT5G19500; hit=AT5G19500; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G19500` (AT5G19500) Tryptophan/tyrosine permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832070] identity=32.4; qcov=0.782; evalue=1.28e-49; confidence=low
Rice	`Os03g0254200` - identity=54.4; qcov=0.178; evalue=1.42e-23; confidence=weak
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784577.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057784577.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784577.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784577.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784577.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23031312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:23031426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B30,B84,C59,C81
`Chr8:23031433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:23031957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:23032065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr8:23032169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr8:23032172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:23032212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C43
`Chr8:23032269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C43
`Chr8:23032990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B35,B78,C61,C62
`Chr8:23033078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr8:23033086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784577.1

505 aa

252

505

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 85-290 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 85-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784577.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	85	290	5.7e-11	42.4	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057784577.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	85	466	2.1e-45	156.3	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928594.1
TTACCGAACATATTTCGGTTGCAAGAAGATATTTCTCTCGTTGTTTGCCGGTCCAACTGTTGTCCACACCCACACCAATCAGCTGCCACCACTGTCCCTTTTCTTCCCAGATTATTGGAGTGAAGTCCCACCTTCTGTGTGTGTATGTGTGTGAAGTTTGATGAGTTTCCACCGTCTGATCTCCTTATCACCCCATCAATCAAGAATTTGCAGAAATCCAAGTCTAACATGGCAGGGCCTTCATCAACAAGAGATCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001946
ATGAGTTTCCACCGTCTGATCTCCTTATCACCCCATCAATCAAGAATTTGCAGAAATCCAAGTCTAACATGGCAGGGCCTTCATCAACAAGAGATCAATTTCTTGAAATCCAGTGCCCGGTTTGGCTGTGGCTTCAGCTACCCTCAACTGGAATACCGAAAGCGATCACACATTTGGAAATTTGCAAAGGTGAAAAACAAGAAATTTGTGATAACTAATTTGGGGCACGATCCTGTGAAAATTAGCAGGAAAAAGGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784577.1
MSFHRLISLSPHQSRICRNPSLTWQGLHQQEINFLKSSARFGCGFSYPQLEYRKRSHIWKFAKVKNKKFVITNLGHDPVKISRKKGSIAGAVALIIGTSIGTGILALPKKTFPAGLVPSSITMTLCWAFLLIEALLLVEINVVLQRKKKVKAESDELEVMSIRTMAQETLGEWGGALATLIYVFLGYTSVVAYCSKSGEILHHLTDFPGSFCGFLFTFLFTILICVGGTRATDQVNQWLTTSMIGLLVAIEVFAVLFGGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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