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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002434`

染色体: Chr08 坐标: 23145909-23148209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002434`
名称	SmilChr08G002434
描述	uncharacterized SmilChr08G002434
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23145909 - 23148209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998208`
GeneID	`130998208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998208`
原始查询	`SmilChr08G002434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=22.9; qcov=0.561; evalue=7.99e-15; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=24.8; qcov=0.534; evalue=2.08e-08; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779621.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779621.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779621.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779621.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23145916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B44,C16,C43
`Chr8:23145917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:23145951`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C66
`Chr8:23145951`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C66
`Chr8:23146035`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B128,B131,B20,B28,B65,B72,B77,B90,B92,C1,C13,C83
`Chr8:23146060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:23146735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B97,C4,C46
`Chr8:23146795`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A20,A25,B107,B133,B140,B19,B37,B50,B87,B97,B99,C11,C31,C4,C46,C55,C69,C70,C74,C87,D3
`Chr8:23146808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A8,B1,B103,B104,B52,B84,C85
`Chr8:23146831`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:23146831`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:23146999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A18,A20,A25,B107,B133,B19,B37,B50,B87,B99,C11,C31,C55,C69,C70,C74,C87,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779621.1

506 aa

253

506

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 208-290 aa PF13456 RVT_3 417-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779621.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	208	290	1.4e-14	55.2	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057779621.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	417	494	1.7e-07	31.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923638.1
ATGGGTCGGTCAATTCATGAAAGCATTATCCTTGCTTCGGAAGGTGTGAACTGTATGGATCGGTCTCTTTATGGTAAGAATCTTGCGCTCAAAGCTGATATCCGGAAAGCCTTCGACACTTTGCATTGGGGTTTCCTTCTTCAGGCTCTTTCTGATTTTGGATGGTCTTTAAAACTTCTCCGGGAATTAGATAAGGCTTGTCGTTCGTTCATTTGGACTGGAAGTACTCTACGCAAACTTTCTACCTCTGTTAATTGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998208
ATGGGTCGGTCAATTCATGAAAGCATTATCCTTGCTTCGGAAGGTGTGAACTGTATGGATCGGTCTCTTTATGGTAAGAATCTTGCGCTCAAAGCTGATATCCGGAAAGCCTTCGACACTTTGCATTGGGGTTTCCTTCTTCAGGCTCTTTCTGATTTTGGATGGTCTTTAAAACTTCTCCGGGAATTAGATAAGGCTTGTCGTTCGTTCATTTGGACTGGAAGTACTCTACGCAAACTTTCTACCTCTGTTAATTGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779621.1
MGRSIHESIILASEGVNCMDRSLYGKNLALKADIRKAFDTLHWGFLLQALSDFGWSLKLLRELDKACRSFIWTGSTLRKLSTSVNWEKTRAIKNKAELATSTVWNEVRQTIQELVVHSFYTIGLGDMIYFWRDNWLGYRIVDKLKIPDYMLPYFNQRISDCYNDDSWHFTVNFIVRFSKIAFDIIATPISGNKDERAWINSNFGDVTASTAFSHLRPSFSKVNWGSWIWGHFILVRRSLLVWRAIMGRLPTFDLCRCHGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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