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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002445`

染色体: Chr08 坐标: 23262878-23263712 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002445`
名称	SmilChr08G002445
描述	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23262878 - 23263712 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998209`
GeneID	`130998209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998209`
原始查询	`SmilChr08G002445`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog, mitochondrial-like
产物	cytochrome c-type biogenesis protein CcmE homolog%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G51790` (G1) transmembrane protein G1P-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824342] identity=69.3; qcov=0.62; evalue=8.54e-40; confidence=medium
Rice	`Os10g0545800` - identity=64; qcov=0.627; evalue=3.85e-34; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0017003 (protein-heme linkage); GO:0017004 (cytochrome complex assembly); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF03100 (CcmE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779622.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779622.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23262900`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B77,C19
`Chr8:23262900`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:23262948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B26,B29,B84,D6
`Chr8:23262955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B44,B60,D11
`Chr8:23262997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A8,B104,B118,B26,B29,B44,B84,C77,D11,D6
`Chr8:23263027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:23263028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B98
`Chr8:23263034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B140,B97,C4,C46
`Chr8:23263095`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B118,B44,D11
`Chr8:23263095`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B118,B44,D11
`Chr8:23263564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C7,C74,C81
`Chr8:23263577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779622.1

142 aa

142

CcmE

PF03100 CcmE 70-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779622.1`	Pfam	`PF03100`	CcmE	Domain	70	138	2.4e-12	47.8	CcmE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923639.1
ATGGCAGTGTATGAAGCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCCTTGTTAAAAATTCTGGTTGAATCTTCAATTAGGGGATGGCGCGATAATAGTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAATGATATTGCCTGTTCTGAATGAAAGACTTAGCTGCATCGCCGGATTCATAATCATTGTGCTCAACCAATTTCAAGATCAATTGGTCTTCTACGTCACCCCCACAGAAGCCCTAGACAAGTACACCTCTGACCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998209
ATGGCAGTGTATGAAGCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCCTTGTTAAAAATTCTGGTTGAATCTTCAATTAGGGGATGGCGCGATAATAGTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAATGATATTGCCTGTTCTGAATGAAAGACTTAGCTGCATCGCCGGATTCATAATCATTGTGCTCAACCAATTTCAAGATCAATTGGTCTTCTACGTCACCCCCACAGAAGCCCTAGACAAGTACACCTCTGACCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779622.1
MAVYEAWTKEQSDALLKILVESSIRGWRDNSGLFSKATVEEMILPVLNERLSCIAGFIIIVLNQFQDQLVFYVTPTEALDKYTSDPKKSKFRLGDLVLENSVAQIPSSSEIQFVITYLITDILVKYEGSLPDLFCEGNLGAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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