当前解析结果
SmilChr08G002464| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002464 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002464 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002464 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 23466268 - 23473253 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998212 |
|---|---|
| GeneID | 130998212 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998212 |
| 原始查询 | SmilChr08G002464 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998212 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779625.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057779625.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779625.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779625.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779625.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:23466309 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 49 | A25,A8,A9,B10,B106,B109,B110,B112,B118,B121,B123,B125,B126,B131,B134,B15,B19,B20,B22,B26,B27,B28,B49,B57,B60,B62,B72,B74,B75,B88,C18,C25,C35,C36,C41,C42,C5,C57,C6,C60,C64,C66,C68,C9,D1,D10,D11,D2,D7 |
Chr8:23466311 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 32 | A13,A2,A20,A23,A5,B10,B102,B109,B122,B124,B126,B136,B139,B20,B27,B3,B34,B64,B69,B73,B84,B95,C21,C30,C32,C45,C52,C71,C74,C84,D4,D9 |
Chr8:23466315 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B124,B73,C21,C30,C74 |
Chr8:23472742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr8:23472765 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。