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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002467`

染色体: Chr08 坐标: 23545435-23550456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002467`
名称	SmilChr08G002467
描述	uncharacterized SmilChr08G002467
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23545435 - 23550456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998214`
GeneID	`130998214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998214`
原始查询	`SmilChr08G002467`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.9; qcov=0.348; evalue=1.72e-32; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=47.8; qcov=0.982; evalue=1.35e-120; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779627.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779627.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779627.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779627.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23545449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B29,C18,C55
`Chr8:23545470`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A14,A15,B100,B108,B119,B128,B132,B17,B26,B34,B37,B48,B67,B83,B85,C10,C12,C17,C38,C40,C50,C58,C77,C83,D1
`Chr8:23545476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A6,B5,B73,B82,C29,C48,C5,C56,C9
`Chr8:23545479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	156	A10,A13,A15,A16,A18,A2,A20,A25,A3,A5,A7,A9,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B118,B120,B121,B123,B126,B127,B128,B131,B134,B138,B140,B15,B16,B2,B20,B22,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C25,C28,C29,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C59,C60,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C72,C77,C78,C79,C81,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:23545491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B90,B92,C21,D3
`Chr8:23545510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A10,B128,B26,B36,B4,B52,B66,C19,C50,C86
`Chr8:23545513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,C39,C45,C80,D4
`Chr8:23549251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B41,B81,B99,C75
`Chr8:23549252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr8:23549268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B17
`Chr8:23549289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B122
`Chr8:23549291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779627.1

396 aa

198

396

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 55-94 aa PF04827 Plant_tran 162-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779627.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	55	94	1.4e-19	70.2	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057779627.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	162	329	7.1e-74	248.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923644.1
ATGAAGGGTTTCTTGAGCGATTTTGAGGGCCTCTATCGATGGTGGTTTGCTGTGAACAGGCTTTCGGCCGTGGCGCAGGGCTTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998214
ATGAAGGGTTTCTTGAGCGATTTTGAGGGCCTCTATCGATGGTGGTTTGCTGTGAACAGGCTTTCGGCCGTGGCGCAGGGCTTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779627.1
MKGFLSDFEGLYRWWFAVNRLSAVAQGLASSYRFDPPPPRPRKKRTVVRRDREGGAERLHRDYFSVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDHYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRLLAYGTAADCCDEYLRIGETTALECMKKFCKAFVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHEFSGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWYGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDILA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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