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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002476`

染色体: Chr08 坐标: 23682687-23686589 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002476`
名称	SmilChr08G002476
描述	uncharacterized SmilChr08G002476
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23682687 - 23686589 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001991`
GeneID	`131001991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001991`
原始查询	`SmilChr08G002476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0128700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0128700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G05510` (AT5G05510) Mad3/BUB1 homology region 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830434] identity=60.8; qcov=0.32; evalue=7.91e-74; confidence=low
Rice	`Os11g0128700` - identity=34.6; qcov=1; evalue=1.32e-91; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0007094 (mitotic spindle assembly checkpoint signaling); GO:0051754 (meiotic sister chromatid cohesion, centromeric)
KEGG	-
Pfam	PF08311 (Mad3_BUB1_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784645.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057784645.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057784645.1`
4	Spindle	Spindle	0.80000	`XP_057784645.1`
5	Spindle pole	Spindle pole	0.40000	`XP_057784645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23683043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:23684113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:23684294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B140,B61,C82,D9
`Chr8:23684513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B140,B45
`Chr8:23684728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:23684754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:23685117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:23685273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784645.1

621 aa

310

621

Mad3_BUB1_I

PF08311 Mad3_BUB1_I 18-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784645.1`	Pfam	`PF08311`	Mad3_BUB1_I	Repeat	18	135	4.9e-34	117.6	Mad3/BUB1 homology region 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928662.1
GGCGCCTTAATGAATTCAAAATTAAGCAATTGCACCTATACCCCCCAAAAAAACCCCTTTCTGCTCAATTTGCAACAAGATGTCAGAGACGAGCAACGCGAAATCTCCTTGCGAAAATCTCTTCTCGTCTCTGATTTCCGAGATCAAATCCTACAATGGGATGGATCCTCTGCTTCCATGGCTTCGTGGGATAAAGAAGATGAAGGAGACGCTGCCGCCTCAGCTTCTGAAAGAGAAACTTCCTCGATTTCTCCAGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001991
ATGTCAGAGACGAGCAACGCGAAATCTCCTTGCGAAAATCTCTTCTCGTCTCTGATTTCCGAGATCAAATCCTACAATGGGATGGATCCTCTGCTTCCATGGCTTCGTGGGATAAAGAAGATGAAGGAGACGCTGCCGCCTCAGCTTCTGAAAGAGAAACTTCCTCGATTTCTCCAGAAATGCGCCGAGACTTTCATGACCGACCGCCGTTACTCCAACGATTTGCGATACCTCCGCGTTTGGTTGCAATTGTTGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784645.1
MSETSNAKSPCENLFSSLISEIKSYNGMDPLLPWLRGIKKMKETLPPQLLKEKLPRFLQKCAETFMTDRRYSNDLRYLRVWLQLLDFVEEPRAVLKTMEMNRIGLKKSLFYQAYALYYEKMKKFDAAEKIYHLGVQNLAEPADELQKSYEQFLYRLERTKKKRVQVQGGDTNKGRLKRDEVRSCKESLHKMDGQPADIRCKDHLLGTEAKFVNIGNKVSLQSSQNEMLVHESNRKHISATSSNIGVLDEELFRKVVVSDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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