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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002485`

染色体: Chr08 坐标: 23753795-23758426 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002485`
名称	SmilChr08G002485
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23753795 - 23758426 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001999`
GeneID	`131001999`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001999`
原始查询	`SmilChr08G002485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha homolog
产物	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha homolog
Arabidopsis	`AT2G40290` (AT2G40290) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818621] identity=78.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0296400` - identity=79.1; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005850 (eukaryotic translation initiation factor 2 complex); GO:0005851 (eukaryotic translation initiation factor 2B complex); GO:0033290 (eukaryotic 48S preinitiation complex); GO:0043022 (ribosome binding); GO:0043614 (multi-eIF complex)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00575 (S1); PF07541 (EIF_2_alpha)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001999

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784655.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784655.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784655.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057784655.1`
5	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057784655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23754122`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A14,B100,B119,B128,B132,B17,B19,B2,B34,B37,B48,B83,B85,C10,C12,C17,C38,C40,C50,C58,C71,C83,D1
`Chr8:23755649`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B110,B118,B56,B68,C20,C55
`Chr8:23755651`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A20,B110,B118,B56,B68,C20,C55
`Chr8:23757964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784655.1

344 aa

172

344

EIF_2_alpha

PF00575 S1 18-92 aa PF07541 EIF_2_alpha 130-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784655.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	18	92	2.8e-12	47.5	S1 RNA binding domain
`XP_057784655.1`	Pfam	`PF07541`	EIF_2_alpha	Family	130	260	1.2e-33	116.3	Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928672.1
AAAGAATAAGATTAAGAAAAAATAAAAATGATTTTTGGTTATTAGAAATGAAAGATTCGCAAAAGAGTGATTGATTCCCCTCTCTCCACACTAAAAACCCCATTCTCTCTCACTATAAAAATTTACTGCCTTAAATTTAATTCGTAGAAGCTCCTTTTCTCTTGCTCGAGTTTCCTCTGTACAAAACCCCATTCCGCAGAAACCCTAATTTCGTAATCTCGGCCGCGGTAGGATCCGACCCGTTTCCATGGCGACAAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001999
ATGGCGACAAACGGGCCGAACCTGGAGTGCCGGATGTACGAGGCCAAGTACCCGGAGGTGGACCAGGCAGTGATGATTCAGGTCAAGAGCATGGCCGACAGCGGCGCGTACGTTTCACTCCTCGAGTACAACAACATCGAGGGCATGATTCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGCCGCATTCGGAGTATCAGCAGCCTCATCAAGGTTGGCCGCATCGAGCCTGTAATGGTGCTCCGTGTCGATAAAGAGAAGGGCTATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784655.1
MATNGPNLECRMYEAKYPEVDQAVMIQVKSMADSGAYVSLLEYNNIEGMILFSELSRRRIRSISSLIKVGRIEPVMVLRVDKEKGYIDLSKRRVSEEDIQGCEERFNKSKLVHSIMRHVAETMNVDLEDLYIHVGWPLYKKYGHAFEAFKVMVNDPNSVLDSLTREVTEVGPDGQEVKKVVPAISDEVKDALVKNIRRRMTPQPLKIRADIEMKCFQFDGVLHIKEAMRKAEAAGNDDCPVKMKLVAAPAYVLNTQTLDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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