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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002491`

染色体: Chr08 坐标: 23837628-23841261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002491`
名称	SmilChr08G002491
描述	ferritin-2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23837628 - 23841261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002006`
GeneID	`131002006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002006`
原始查询	`SmilChr08G002491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferritin-2, chloroplastic
产物	ferritin-2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G11050` (FER2) ferritin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820276] identity=71.8; qcov=0.996; evalue=2.26e-128; confidence=high
Rice	`Os12g0106000` (FER2) - identity=71.2; qcov=0.895; evalue=2.17e-116; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006826 (iron ion transport); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00210 (Ferritin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784664.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057784663.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057784663.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784664.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23838028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C46
`Chr8:23838031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B41,B48,C15
`Chr8:23838058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B41,C15
`Chr8:23838671`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D7
`Chr8:23838671`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D7
`Chr8:23840624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B84,C28
`Chr8:23840987`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A20,B18
`Chr8:23840987`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A20,B18
`Chr8:23841013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784663.1

259 aa

130

259

Ferritin

PF00210 Ferritin 93-237 aa

XP_057784664.1

256 aa

128

256

Ferritin

PF00210 Ferritin 93-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784663.1`	Pfam	`PF00210`	Ferritin	Domain	93	237	3.3e-33	115.3	Ferritin-like domain
`XP_057784664.1`	Pfam	`PF00210`	Ferritin	Domain	93	237	3.2e-33	115.4	Ferritin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928680.1
CGGAGTATTTGAAGAGCAGTGAGCGCATGAATATCACTTCAGCGGTCCGGAGGCAGGGTCCCACTCCAGATTTATCCGTTCCATGAGGTCGGCACGCTCTTCTTCACAAGCACTCAATCCTCTCCATCCACGTGTCCTCTTATCCAACGGCCCCCATCCTCCAACCCCCTTCGTTTCCACAAACATACATCATCGCCCACTCTCGCTGTCGCTCCACACTCACTCACTCCCCCATCTCTCTCTCTCCAAGAACACAGATA...

XM_057928681.1
CGGAGTATTTGAAGAGCAGTGAGCGCATGAATATCACTTCAGCGGTCCGGAGGCAGGGTCCCACTCCAGATTTATCCGTTCCATGAGGTCGGCACGCTCTTCTTCACAAGCACTCAATCCTCTCCATCCACGTGTCCTCTTATCCAACGGCCCCCATCCTCCAACCCCCTTCGTTTCCACAAACATACATCATCGCCCACTCTCGCTGTCGCTCCACACTCACTCACTCCCCCATCTCTCTCTCTCCAAGAACACAGATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131002006
ATGCTTCTCAAAGCTGCGCCTGCGTTTGGTCTGTTGAATTCGCAGGGGGAAAATCTGAGCGCTCTGTTCGTCTCAACATCCTCCTCGCTTGCGCTCAAGAATCTCGACGGAAGAAACAGAAATGGATTCGTGGTGTGCGCGGCCAAGCACACCAACAGCAAGCCCCTAACCGGCGTCCTTTTCGAGCCATTCGAAGAGGTGAAGAAGGAACTCATGCTCGTGCCCAGCGTCTCTCAAGCCTCTCTCGCTCGCCATAAGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784663.1
MLLKAAPAFGLLNSQGENLSALFVSTSSSLALKNLDGRNRNGFVVCAAKHTNSKPLTGVLFEPFEEVKKELMLVPSVSQASLARHKYSDECEAAINDQINVEYNVSYVYHAMFAYFDRDNVALKGLAKFFKDSSLEEREHAEKLMEYQNKRGGKVKLQSIVMPLSEFDHAEKGDALYAMELALSLEKLTNEKLLNLHAVASKSNDVQLTDFVESEYLGEQVESIKKISEYVAQLRRVGKGHGKDYSEQNPTFSSKFSSV

XP_057784664.1
MLLKAAPAFGLLNSQGENLSALFVSTSSSLALKNLDGRNRNGFVVCAAKHTNSKPLTGVLFEPFEEVKKELMLVPSVSQASLARHKYSDECEAAINDQINVEYNVSYVYHAMFAYFDRDNVALKGLAKFFKDSSLEEREHAEKLMEYQNKRGGKVKLQSIVMPLSEFDHAEKGDALYAMELALSLEKLTNEKLLNLHAVASKSNDVQLTDFVESEYLGEQVESIKKISEYVAQLRRVGKGHGVWHFDQMLLEEVIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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