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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002498`

染色体: Chr08 坐标: 23979715-23981554 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002498`
名称	SmilChr08G002498
描述	protein trichome birefringence-like 33
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23979715 - 23981554 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002012`
GeneID	`131002012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002012`
原始查询	`SmilChr08G002498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 33
产物	protein trichome birefringence-like 33
Arabidopsis	`AT2G40320` (TBL33) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818625] identity=73.1; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0817900` (OsTBL5) - identity=59.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057784671.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784671.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784671.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784671.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23979810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:23979819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:23979900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B132,C41,C65
`Chr8:23979941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B91
`Chr8:23980077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:23980106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:23980181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr8:23980210`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C64
`Chr8:23980210`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C64
`Chr8:23980220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B90
`Chr8:23980220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr8:23980236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784671.1

418 aa

209

418

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 74-126 aa PF13839 PC-Esterase 127-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784671.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	74	126	2.8e-22	79.5	PMR5 N terminal Domain
`XP_057784671.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	127	413	6e-88	296.2	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928688.1
TTCAAGTACGTACGCACGCACTCCTCGTGTATAATAACGCAAAAATTAACACAAACCTCAATAGCCAAAAACATGAAGGTGACGTCCGCCGCCCTCCTCCGCAAGGGGCGGCTGTCGCCGTACCTCTTCACCTTACTGGCCTTTATTCTGTTCGTGACGATCCTCTACAGCGTAGACTTCAGCTGCATCATCGGCGGCCAATTCGAGGACTACGGCCCGTACCGGAGCCTGTCGTTGGCAACAAAGAAGAAGGGAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002012
ATGAAGGTGACGTCCGCCGCCCTCCTCCGCAAGGGGCGGCTGTCGCCGTACCTCTTCACCTTACTGGCCTTTATTCTGTTCGTGACGATCCTCTACAGCGTAGACTTCAGCTGCATCATCGGCGGCCAATTCGAGGACTACGGCCCGTACCGGAGCCTGTCGTTGGCAACAAAGAAGAAGGGAGAAAAGCTAGCCTTCGCGGTGGAAGAGGCGGAGAGCGGCTGCGACGTCTTCAGCGGGCGGTGGGTGTGGGACGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784671.1
MKVTSAALLRKGRLSPYLFTLLAFILFVTILYSVDFSCIIGGQFEDYGPYRSLSLATKKKGEKLAFAVEEAESGCDVFSGRWVWDERRPLYEESDCPYIQPQLTCREQGRPDTNYQHWRWQPHACSLPSFNATLVLESLRGKRMMFVGDSLNWGQFVSMVCLVHKLLPDHAKSMTTNGSLTVFTAKDYNATIEFYWAPFLMESNSDNPIVHRISDRLVRKGSINKHGKHWKGVDIMVFNTYLWWMRGPKFKILQGSFDDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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