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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002511`

染色体: Chr08 坐标: 24254133-24255172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002511`
名称	SmilChr08G002511
描述	PRA1 family protein B3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24254133 - 24255172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998848`
GeneID	`130998848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998848`
原始查询	`SmilChr08G002511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein B3-like
产物	PRA1 family protein B3-like
Arabidopsis	`AT2G38360` (PRA1.B4) prenylated RAB acceptor 1.B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818416] identity=62.1; qcov=0.934; evalue=1.05e-91; confidence=high
Rice	`Os05g0474400` (OsPRA1) - identity=61.2; qcov=0.887; evalue=2.43e-71; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057780234.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780234.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057780234.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057780234.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24254486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:24254573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:24254700`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr8:24254700`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr8:24254941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,B98,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780234.1

212 aa

106

212

PRA1

PF03208 PRA1 39-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780234.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	39	182	4.2e-49	166.5	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924251.1
GAATGAAATGAAAAAAATAAAAGAAATGCAATATCAGTGACACTAAACGCAAAGTAGCAACCATACTATACTACTGAATTTTCTCTCTCTAGATCAGCCAATCAAACCCTCCCGAAATTTCCTCTCTCTAAATCAGCTATGGCCACCGCGTCGACTCTCCCGATCTCCAATACCTCATCTGAATCCCAGCCTCCCATCGCCACCCCCGCGTTCCGCGCCTTTCTTGCCCGCCTCAATTCCTCCGTCCGCAACGGCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998848
ATGGCCACCGCGTCGACTCTCCCGATCTCCAATACCTCATCTGAATCCCAGCCTCCCATCGCCACCCCCGCGTTCCGCGCCTTTCTTGCCCGCCTCAATTCCTCCGTCCGCAACGGCCTCGCGCAGCGCCGCCCCTGGTTGGAGCTCATCGACCGCTCCGCCTTCAACCGCCCCGATACCATCGCCGAAGCCGCCTCCCGCATCCGCAAAAACTTCTCCTACTTCCGCGTCAACTACATTTTCCTAATCTCCCTCTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780234.1
MATASTLPISNTSSESQPPIATPAFRAFLARLNSSVRNGLAQRRPWLELIDRSAFNRPDTIAEAASRIRKNFSYFRVNYIFLISLSLAFSLLSHPFSLLVLLSLLAAWLFLYLFRPSDQPVVVGGRTFSDREILGILVVSTIVVVFLTSVGSLLISALLVGLAVVCTHGAFRMPEDLFLDEQEPITTGFMSFLGGAASSAAAAAAPAVATRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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