当前解析结果
SmilChr08G002530| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002530 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002530 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002530 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 24526022 - 24533514 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997171 |
|---|---|
| GeneID | 130997171 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997171 |
| 原始查询 | SmilChr08G002530 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | phosphoadenosine phosphosulfate (PAPS) reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831843]; symbol=AT5G03430; hit=AT5G03430; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | phosphoadenosine phosphosulfate (PAPS) reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831843]; symbol=AT5G03430; hit=AT5G03430; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G03430 (AT5G03430)phosphoadenosine phosphosulfate (PAPS) reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831843] identity=70.1; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os01g0259600- identity=65.7; qcov=0.278; evalue=1.44e-56; confidence=weak |
| GO | GO:0003919 (FMN adenylyltransferase activity); GO:0006747 (FAD biosynthetic process) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00994 (MoCF_biosynth); PF01507 (PAPS_reduct) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997171 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057778409.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057778409.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778409.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778409.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778409.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:24528506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778409.1PF01507
PAPS_reduct 38-202 aa
PF00994
MoCF_biosynth 265-362 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778409.1 |
Pfam | PF01507 |
PAPS_reduct | Domain | 38 | 202 | 1.2e-24 | 88.0 | Phosphoadenosine phosphosulfate reductase domain |
XP_057778409.1 |
Pfam | PF00994 |
MoCF_biosynth | Domain | 265 | 362 | 4.2e-16 | 59.7 | Probable molybdopterin binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。